Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.542e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-206ENST00000518283 574 ntTSL 48.16□□□□□ -1.12e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.112e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-203ENST00000517672 548 ntTSL 56.21□□□□□ -1.422e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-213ENST00000519142 696 ntTSL 56.08□□□□□ -1.442e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-228ENST00000523993 581 ntTSL 36.02□□□□□ -1.452e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-222ENST00000522702 544 ntTSL 45.23□□□□□ -1.572e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.682e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 FAM49B-225ENST00000523288 4552 ntTSL 24.06□□□□□ -1.762e-15■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 CHST10-211ENST00000485085 564 ntTSL 419.52■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 35.5
DDX3XO00571 CTSB-224ENST00000532392 570 ntTSL 414.99□□□□□ -0.013e-13■■■■■ 35.4
DDX3XO00571 ATXN1L-203ENST00000569119 428 ntTSL 517.72■□□□□ 0.433e-22■■■■■ 35.4
DDX3XO00571 IST1-225ENST00000568581 503 ntTSL 514.53□□□□□ -0.083e-22■■■■■ 35.4
DDX3XO00571 ATXN1L-201ENST00000427980 7886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.83e-22■■■■■ 35.4
DDX3XO00571 ATXN1L-202ENST00000565676 445 ntTSL 36□□□□□ -1.453e-22■■■■■ 35.4
DDX3XO00571 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.999e-21■■■■■ 35.4
DDX3XO00571 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.859e-21■■■■■ 35.4
DDX3XO00571 TSEN34-206ENST00000456872 853 ntTSL 225.8■■□□□ 1.729e-21■■■■■ 35.4
DDX3XO00571 TSEN34-205ENST00000455798 956 ntTSL 225.64■■□□□ 1.79e-21■■■■■ 35.4
DDX3XO00571 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.649e-21■■■■■ 35.4
DDX3XO00571 TSEN34-207ENST00000496583 2372 ntTSL 224.49■■□□□ 1.519e-21■■■■■ 35.4
DDX3XO00571 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.669e-21■■■■■ 35.4
DDX3XO00571 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.482e-8■■■■■ 35.4
DDX3XO00571 CHMP2A-202ENST00000596708 687 ntTSL 310.5□□□□□ -0.732e-8■■■■■ 35.4
DDX3XO00571 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.21e-12■■■■■ 35.3
DDX3XO00571 KLHL12-201ENST00000367258 1033 ntTSL 57.43□□□□□ -1.221e-12■■■■■ 35.3
DDX3XO00571 XXYLT1-206ENST00000455281 557 ntTSL 419.77■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.472e-9■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 FIBP-206ENST00000528937 1378 ntTSL 219.63■□□□□ 0.733e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 FIBP-211ENST00000533037 1010 ntTSL 518.64■□□□□ 0.573e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.523e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.433e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 FIBP-208ENST00000532229 757 ntTSL 315.96■□□□□ 0.153e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 FIBP-204ENST00000442885 980 ntTSL 215.93■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.123e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 FIBP-203ENST00000426652 587 ntTSL 314.95□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 FIBP-209ENST00000532679 1046 ntTSL 1 (best)14.95□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 IPO7-202ENST00000527431 607 ntTSL 420.67■□□□□ 0.95e-9■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 IPO7-206ENST00000533233 578 ntTSL 413.28□□□□□ -0.285e-9■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.365e-9■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.453e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.833e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 UFSP2-209ENST00000514247 2348 ntTSL 215.99■□□□□ 0.159e-9■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 MTCP1-204ENST00000482244 1138 ntTSL 215.01□□□□□ -0.013e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 MTCP1-203ENST00000476116 738 ntTSL 414.73□□□□□ -0.053e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 UFSP2-204ENST00000505357 490 ntTSL 313.96□□□□□ -0.179e-9■■■■■ 35.2
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DDX3XO00571 UFSP2-203ENST00000502428 565 ntTSL 412.74□□□□□ -0.379e-9■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 UFSP2-201ENST00000264689 1630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.459e-9■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 UBE2L6-204ENST00000527022 668 ntTSL 312.14□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 UFSP2-207ENST00000510755 1672 ntTSL 511.94□□□□□ -0.59e-9■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 MTCP1-201ENST00000362018 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.963e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 UBE2L6-205ENST00000528275 605 ntTSL 26.82□□□□□ -1.321e-6■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 YIF1A-212ENST00000528575 532 ntTSL 319.28■□□□□ 0.688e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 YIF1A-204ENST00000431556 619 ntTSL 216.24■□□□□ 0.198e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-8■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.763e-11■■■■■ 35.2
DDX3XO00571 LINC00963-205ENST00000444184 1887 ntTSL 1 (best)21.06■□□□□ 0.966e-11■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.436e-11■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 ZNF511-203ENST00000463816 605 ntTSL 518.2■□□□□ 0.56e-7■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.944e-11■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 ADAR-206ENST00000494866 471 ntTSL 214.62□□□□□ -0.071e-15■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-15■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 ADAR-204ENST00000471068 577 ntTSL 412.33□□□□□ -0.441e-15■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 ADAR-203ENST00000463920 2347 ntTSL 211.08□□□□□ -0.641e-15■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 ADAR-201ENST00000368471 6515 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.691e-15■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 ADAR-207ENST00000526905 490 ntTSL 37.85□□□□□ -1.151e-15■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.294e-8■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MAP3K7-205ENST00000369332 4830 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.491e-25■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MAP3K7-204ENST00000369329 4911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.531e-25■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.471e-25■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.81e-25■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.169e-13■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.619e-13■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 FAM177A1-209ENST00000555211 476 ntAPPRIS ALT2 TSL 419.35■□□□□ 0.696e-10■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 FAM177A1-203ENST00000396472 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.396e-10■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.477e-15■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.437e-15■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 STARD3NL-207ENST00000471550 3653 ntTSL 211.64□□□□□ -0.557e-15■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MATR3-221ENST00000513121 573 ntTSL 219.51■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MATR3-208ENST00000504045 1530 ntTSL 517.34■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MATR3-222ENST00000513678 444 ntTSL 217.08■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MATR3-220ENST00000512876 575 ntTSL 316.98■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MATR3-212ENST00000507860 571 ntTSL 47.32□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MATR3-218ENST00000511978 573 ntTSL 37.12□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MATR3-209ENST00000504311 423 ntTSL 36.03□□□□□ -1.442e-7■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MATR3-216ENST00000511249 447 ntTSL 45.74□□□□□ -1.492e-7■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 MATR3-214ENST00000509918 377 ntTSL 45.18□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 35.1
DDX3XO00571 TXNDC15-210ENST00000511070 1006 ntTSL 1 (best)16.94■□□□□ 0.33e-11■■■■■ 35
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