RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485085.5

CHST10-211, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 10, humanhuman

TSL 4

Gene CHST10, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST10-211ENST00000485085 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.42■■■■■ 5.02
CHST10-211ENST00000485085 ABCC9O60706 1549 aa42.29■■■■■ 4.36
CHST10-211ENST00000485085 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.67■■■■■ 4.26
CHST10-211ENST00000485085 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.17■■■■■ 4.02
CHST10-211ENST00000485085 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.93■■■■□ 3.98
CHST10-211ENST00000485085 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.58■■■■□ 3.93
CHST10-211ENST00000485085 NACADO15069 1562 aa39.57■■■■□ 3.92
CHST10-211ENST00000485085 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.43■■■■□ 3.9
CHST10-211ENST00000485085 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.04■■■■□ 3.84
CHST10-211ENST00000485085 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.87■■■■□ 3.81
CHST10-211ENST00000485085 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.84■■■■□ 3.81
CHST10-211ENST00000485085 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
CHST10-211ENST00000485085 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.22■■■■□ 3.71
CHST10-211ENST00000485085 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.12■■■■□ 3.69
CHST10-211ENST00000485085 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.11■■■■□ 3.69
CHST10-211ENST00000485085 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.09■■■■□ 3.69
CHST10-211ENST00000485085 SCRIBQ14160 1630 aa38.09■■■■□ 3.69
CHST10-211ENST00000485085 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
CHST10-211ENST00000485085 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.08■■■■□ 3.53
CHST10-211ENST00000485085 NCAPD3P42695 1498 aa36.6■■■■□ 3.45
CHST10-211ENST00000485085 CUX2O14529 1486 aa36.48■■■■□ 3.43
CHST10-211ENST00000485085 ERCC6Q03468 1493 aa36.48■■■■□ 3.43
CHST10-211ENST00000485085 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.45■■■■□ 3.43
CHST10-211ENST00000485085 SMARCA4P51532 1647 aa36.26■■■■□ 3.39
CHST10-211ENST00000485085 SMARCA2P51531 1590 aa36.24■■■■□ 3.39
CHST10-211ENST00000485085 NESP48681 1621 aa36.23■■■■□ 3.39
CHST10-211ENST00000485085 HMGXB3Q12766 1538 aa36.2■■■■□ 3.39
CHST10-211ENST00000485085 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
CHST10-211ENST00000485085 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
CHST10-211ENST00000485085 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.86■■■■□ 3.33
CHST10-211ENST00000485085 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.81■■■■□ 3.32
CHST10-211ENST00000485085 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
CHST10-211ENST00000485085 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.76■■■■□ 3.31
CHST10-211ENST00000485085 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.64■■■■□ 3.3
CHST10-211ENST00000485085 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.64■■■■□ 3.3
CHST10-211ENST00000485085 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.51■■■■□ 3.27
CHST10-211ENST00000485085 TRIM41Q8WV44 630 aa35.35■■■■□ 3.25
CHST10-211ENST00000485085 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.35■■■■□ 3.25
CHST10-211ENST00000485085 WIZO95785 1651 aa35.34■■■■□ 3.25
CHST10-211ENST00000485085 WDR62O43379 1518 aa35.23■■■■□ 3.23
CHST10-211ENST00000485085 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.11■■■■□ 3.21
CHST10-211ENST00000485085 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.08■■■■□ 3.21
CHST10-211ENST00000485085 CFTRP13569 1480 aa34.98■■■■□ 3.19
CHST10-211ENST00000485085 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
CHST10-211ENST00000485085 OSCARQ8IYS5 282 aa34.91■■■■□ 3.18
CHST10-211ENST00000485085 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
CHST10-211ENST00000485085 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
CHST10-211ENST00000485085 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.52■■■■□ 3.12
CHST10-211ENST00000485085 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
CHST10-211ENST00000485085 PRDM2Q13029 1718 aa34.44■■■■□ 3.1
CHST10-211ENST00000485085 IFT140Q96RY7 1462 aa34.43■■■■□ 3.1
CHST10-211ENST00000485085 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.39■■■■□ 3.1
CHST10-211ENST00000485085 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.39■■■■□ 3.1
CHST10-211ENST00000485085 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.39■■■■□ 3.1
CHST10-211ENST00000485085 TOPBP1Q92547 1522 aa34.36■■■■□ 3.09
CHST10-211ENST00000485085 ARHGEF11O15085 1522 aa34.25■■■■□ 3.07
CHST10-211ENST00000485085 ABCC8Q09428 1581 aa34.19■■■■□ 3.06
CHST10-211ENST00000485085 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CHST10-211ENST00000485085 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.17■■■■□ 3.06
CHST10-211ENST00000485085 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.17■■■■□ 3.06
CHST10-211ENST00000485085 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.15■■■■□ 3.06
CHST10-211ENST00000485085 FBLN2P98095 1184 aa34.08■■■■□ 3.05
CHST10-211ENST00000485085 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
CHST10-211ENST00000485085 CHD1O14646 1710 aa34.01■■■■□ 3.03
CHST10-211ENST00000485085 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
CHST10-211ENST00000485085 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.95■■■■□ 3.03
CHST10-211ENST00000485085 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
CHST10-211ENST00000485085 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
CHST10-211ENST00000485085 ARAP1Q96P48 1450 aa33.91■■■■□ 3.02
CHST10-211ENST00000485085 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
CHST10-211ENST00000485085 SOGA1O94964 1423 aa33.88■■■■□ 3.01
CHST10-211ENST00000485085 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.74■■■□□ 2.99
CHST10-211ENST00000485085 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.73■■■□□ 2.99
CHST10-211ENST00000485085 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
CHST10-211ENST00000485085 CUX1P39880 1505 aa33.65■■■□□ 2.98
CHST10-211ENST00000485085 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.61■■■□□ 2.97
CHST10-211ENST00000485085 GRIN2BQ13224 1484 aa33.57■■■□□ 2.97
CHST10-211ENST00000485085 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
CHST10-211ENST00000485085 WDR97A6NE52 1622 aa33.55■■■□□ 2.96
CHST10-211ENST00000485085 SYNJ1O43426 1573 aa33.53■■■□□ 2.96
CHST10-211ENST00000485085 SYNJ2O15056 1496 aa33.49■■■□□ 2.95
CHST10-211ENST00000485085 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.43■■■□□ 2.94
CHST10-211ENST00000485085 PBRM1Q86U86 1689 aa33.33■■■□□ 2.93
CHST10-211ENST00000485085 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.29■■■□□ 2.92
CHST10-211ENST00000485085 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.24■■■□□ 2.91
CHST10-211ENST00000485085 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
CHST10-211ENST00000485085 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.17■■■□□ 2.9
CHST10-211ENST00000485085 GRIN2AQ12879 1464 aa33.13■■■□□ 2.89
CHST10-211ENST00000485085 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.11■■■□□ 2.89
CHST10-211ENST00000485085 NUP160Q12769 1436 aa33.04■■■□□ 2.88
CHST10-211ENST00000485085 CEP170Q5SW79 1584 aa33.04■■■□□ 2.88
CHST10-211ENST00000485085 ADAMTS12P58397 1594 aa33.02■■■□□ 2.88
CHST10-211ENST00000485085 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.97■■■□□ 2.87
CHST10-211ENST00000485085 TOP2BQ02880 1626 aa32.94■■■□□ 2.86
CHST10-211ENST00000485085 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.91■■■□□ 2.86
CHST10-211ENST00000485085 SHROOM2Q13796 1616 aa32.88■■■□□ 2.85
CHST10-211ENST00000485085 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.83■■■□□ 2.85
CHST10-211ENST00000485085 JPH4Q96JJ6 628 aa32.82■■■□□ 2.84
CHST10-211ENST00000485085 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
CHST10-211ENST00000485085 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.67■■■□□ 2.82
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