Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 EPB41L2-225ENST00000530707 565 ntTSL 411.92□□□□□ -0.53e-9■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 EPB41L2-203ENST00000368128 4456 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.553e-9■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.563e-9■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.563e-9■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 EPB41L2-232ENST00000628542 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.743e-9■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.793e-9■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 EPB41L2-224ENST00000530481 3914 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.843e-9■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.923e-9■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 EPB41L2-219ENST00000528179 560 ntTSL 56.04□□□□□ -1.443e-9■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 EPB41L2-212ENST00000526333 549 ntTSL 56.03□□□□□ -1.443e-9■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.212e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL2-204ENST00000566097 904 ntTSL 225.81■■□□□ 1.724e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL2-205ENST00000567586 557 ntTSL 423.7■■□□□ 1.384e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL2-203ENST00000561708 581 ntTSL 416.12■□□□□ 0.174e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.044e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 AKT1-218ENST00000557552 8396 ntTSL 516.01■□□□□ 0.156e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MSH6-207ENST00000456246 846 ntTSL 316.81■□□□□ 0.281e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.411e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MSH6-208ENST00000493177 813 ntTSL 312.43□□□□□ -0.421e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.471e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.511e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.541e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.621e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MSH6-204ENST00000445503 4158 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.651e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 MSH6-211ENST00000606499 833 ntTSL 37.04□□□□□ -1.281e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.046e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.066e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 WDR6-214ENST00000488572 610 ntTSL 419.08■□□□□ 0.643e-9■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.981e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.641e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 CCM2-211ENST00000478582 937 ntTSL 324.75■■□□□ 1.551e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.531e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 CCM2-203ENST00000461377 1983 ntTSL 518.21■□□□□ 0.511e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 CCM2-216ENST00000488727 1719 ntTSL 517.71■□□□□ 0.431e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 KLC1-211ENST00000538504 822 ntTSL 221.54■■□□□ 1.044e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.874e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 KLC1-226ENST00000557686 535 ntTSL 320.23■□□□□ 0.834e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.524e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.474e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.254e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.134e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.084e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 SH3BP2-224ENST00000513020 868 ntTSL 311.18□□□□□ -0.622e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 CTDSP1-207ENST00000473420 922 ntTSL 317.53■□□□□ 0.43e-11■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 CTDSP1-215ENST00000498160 877 ntTSL 516.15■□□□□ 0.183e-11■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.083e-11■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.063e-11■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 CTDSP1-214ENST00000497677 998 ntTSL 214.88□□□□□ -0.033e-11■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 CTDSP1-205ENST00000452977 818 ntTSL 514.65□□□□□ -0.063e-11■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 CTDSP1-210ENST00000491064 786 ntTSL 313.03□□□□□ -0.323e-11■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 CTDSP1-212ENST00000494067 362 ntTSL 312.69□□□□□ -0.383e-11■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.541e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.067e-10■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.967e-10■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 NPM1-208ENST00000521672 597 ntTSL 57.63□□□□□ -1.197e-10■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 NPM1-205ENST00000518587 670 ntTSL 26.91□□□□□ -1.37e-10■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.317e-10■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 NPM1-211ENST00000523622 247 ntTSL 36.34□□□□□ -1.397e-10■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.417e-10■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 NPM1-210ENST00000523339 268 ntTSL 23.72□□□□□ -1.817e-10■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 GDPD5-213ENST00000532435 825 ntTSL 521.06■□□□□ 0.962e-8■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-7■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 ABR-235ENST00000576964 574 ntTSL 410.05□□□□□ -0.83e-6■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 GABPB1-AS1-204ENST00000560359 709 ntTSL 222.17■■□□□ 1.142e-12■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 GABPB1-AS1-201ENST00000499326 717 ntTSL 27.57□□□□□ -1.22e-12■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 GABPB1-AS1-205ENST00000561289 554 ntTSL 36.59□□□□□ -1.352e-12■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.72e-12■■■■□ 21.4
CSTF2TQ9H0L4 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 212.05□□□□□ -0.484e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 SLC4A2-206ENST00000466368 548 ntTSL 414.42□□□□□ -0.18e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.233e-6■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 DHDDS-202ENST00000360009 3245 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.834e-6■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 DHDDS-208ENST00000431933 2673 ntTSL 59.03□□□□□ -0.964e-6■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 DHDDS-209ENST00000434391 3338 ntTSL 1 (best)8.61□□□□□ -1.034e-6■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.061e-6■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 GAK-220ENST00000513935 573 ntTSL 212.51□□□□□ -0.411e-6■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.042e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 NDEL1-211ENST00000581679 582 ntTSL 44.65□□□□□ -1.672e-17■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.951e-6■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11e-6■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.451e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.237e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 TNFRSF12A-203ENST00000571351 1678 ntTSL 218.57■□□□□ 0.567e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 TNFRSF12A-205ENST00000574699 583 ntTSL 218.21■□□□□ 0.517e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.517e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.117e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.57e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 DPH1-213ENST00000575667 1644 ntTSL 1 (best)21.98■■□□□ 1.117e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 DPH1-206ENST00000571418 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.27■□□□□ 0.847e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 DPH1-211ENST00000572819 1345 ntTSL 520.24■□□□□ 0.837e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.787e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 DPH1-215ENST00000576129 991 ntTSL 217.88■□□□□ 0.457e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.457e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 DPH1-204ENST00000570833 558 ntTSL 511.87□□□□□ -0.517e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.752e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 ZNF451-209ENST00000502749 790 ntTSL 518.2■□□□□ 0.52e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 ZNF451-216ENST00000510483 719 ntTSL 418.08■□□□□ 0.482e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 ZNF451-207ENST00000444273 3402 ntTSL 1 (best)14.65□□□□□ -0.062e-7■■■■□ 21.3
CSTF2TQ9H0L4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 21.3
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