RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538504.6

KLC1-211, Transcript of kinesin light chain 1, humanhuman

TSL 2

Gene KLC1, Length 822 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC1-211ENST00000538504 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.98■■■■■ 6.55
KLC1-211ENST00000538504 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.74■■■■■ 5.55
KLC1-211ENST00000538504 ABCC9O60706 1549 aa48.98■■■■■ 5.43
KLC1-211ENST00000538504 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.11■■■■■ 5.13
KLC1-211ENST00000538504 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.94■■■■■ 5.11
KLC1-211ENST00000538504 NACADO15069 1562 aa46.85■■■■■ 5.09
KLC1-211ENST00000538504 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
KLC1-211ENST00000538504 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.45■■■■■ 5.03
KLC1-211ENST00000538504 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.22■■■■■ 4.99
KLC1-211ENST00000538504 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.91■■■■■ 4.94
KLC1-211ENST00000538504 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.84■■■■■ 4.93
KLC1-211ENST00000538504 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.55■■■■■ 4.88
KLC1-211ENST00000538504 SCRIBQ14160 1630 aa45.49■■■■■ 4.87
KLC1-211ENST00000538504 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.18■■■■■ 4.82
KLC1-211ENST00000538504 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.91■■■■■ 4.78
KLC1-211ENST00000538504 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
KLC1-211ENST00000538504 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.24■■■■■ 4.67
KLC1-211ENST00000538504 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.98■■■■■ 4.63
KLC1-211ENST00000538504 SMARCA4P51532 1647 aa43.45■■■■■ 4.55
KLC1-211ENST00000538504 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
KLC1-211ENST00000538504 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.27■■■■■ 4.52
KLC1-211ENST00000538504 NCAPD3P42695 1498 aa43.25■■■■■ 4.51
KLC1-211ENST00000538504 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.18■■■■■ 4.5
KLC1-211ENST00000538504 SMARCA2P51531 1590 aa43.17■■■■■ 4.5
KLC1-211ENST00000538504 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.97■■■■■ 4.47
KLC1-211ENST00000538504 HMGXB3Q12766 1538 aa42.97■■■■■ 4.47
KLC1-211ENST00000538504 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
KLC1-211ENST00000538504 WIZO95785 1651 aa42.72■■■■■ 4.43
KLC1-211ENST00000538504 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
KLC1-211ENST00000538504 NESP48681 1621 aa42.34■■■■■ 4.37
KLC1-211ENST00000538504 ERCC6Q03468 1493 aa42.19■■■■■ 4.34
KLC1-211ENST00000538504 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
KLC1-211ENST00000538504 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.11■■■■■ 4.33
KLC1-211ENST00000538504 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.03■■■■■ 4.32
KLC1-211ENST00000538504 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.88■■■■■ 4.3
KLC1-211ENST00000538504 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.79■■■■■ 4.28
KLC1-211ENST00000538504 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.78■■■■■ 4.28
KLC1-211ENST00000538504 CUX2O14529 1486 aa41.72■■■■■ 4.27
KLC1-211ENST00000538504 CFTRP13569 1480 aa41.71■■■■■ 4.27
KLC1-211ENST00000538504 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
KLC1-211ENST00000538504 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
KLC1-211ENST00000538504 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.53■■■■■ 4.24
KLC1-211ENST00000538504 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.47■■■■■ 4.23
KLC1-211ENST00000538504 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.43■■■■■ 4.22
KLC1-211ENST00000538504 PRDM2Q13029 1718 aa41.33■■■■■ 4.21
KLC1-211ENST00000538504 WDR62O43379 1518 aa41.27■■■■■ 4.2
KLC1-211ENST00000538504 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
KLC1-211ENST00000538504 TOPBP1Q92547 1522 aa40.85■■■■■ 4.13
KLC1-211ENST00000538504 ABCC8Q09428 1581 aa40.81■■■■■ 4.12
KLC1-211ENST00000538504 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.75■■■■■ 4.11
KLC1-211ENST00000538504 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.75■■■■■ 4.11
KLC1-211ENST00000538504 IFT140Q96RY7 1462 aa40.61■■■■■ 4.09
KLC1-211ENST00000538504 CUX1P39880 1505 aa40.49■■■■■ 4.07
KLC1-211ENST00000538504 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
KLC1-211ENST00000538504 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
KLC1-211ENST00000538504 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
KLC1-211ENST00000538504 SOGA1O94964 1423 aa40.39■■■■■ 4.06
KLC1-211ENST00000538504 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.39■■■■■ 4.06
KLC1-211ENST00000538504 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.39■■■■■ 4.06
KLC1-211ENST00000538504 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.29■■■■■ 4.04
KLC1-211ENST00000538504 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
KLC1-211ENST00000538504 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
KLC1-211ENST00000538504 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.19■■■■■ 4.022e-10■■■■■ 91.9
KLC1-211ENST00000538504 OSCARQ8IYS5 282 aa40.13■■■■■ 4.01
KLC1-211ENST00000538504 SYNJ1O43426 1573 aa40.09■■■■■ 4.01
KLC1-211ENST00000538504 TOP2BQ02880 1626 aa40.08■■■■■ 4.01
KLC1-211ENST00000538504 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.06■■■■■ 4
KLC1-211ENST00000538504 WDR97A6NE52 1622 aa39.98■■■■□ 3.99
KLC1-211ENST00000538504 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.95■■■■□ 3.99
KLC1-211ENST00000538504 FBLN2P98095 1184 aa39.93■■■■□ 3.98
KLC1-211ENST00000538504 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.88■■■■□ 3.98
KLC1-211ENST00000538504 GRIN2BQ13224 1484 aa39.87■■■■□ 3.97
KLC1-211ENST00000538504 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.84■■■■□ 3.97
KLC1-211ENST00000538504 CHD1O14646 1710 aa39.82■■■■□ 3.96
KLC1-211ENST00000538504 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.77■■■■□ 3.96
KLC1-211ENST00000538504 PBRM1Q86U86 1689 aa39.76■■■■□ 3.96
KLC1-211ENST00000538504 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
KLC1-211ENST00000538504 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
KLC1-211ENST00000538504 SYNJ2O15056 1496 aa39.62■■■■□ 3.93
KLC1-211ENST00000538504 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.45■■■■□ 3.91
KLC1-211ENST00000538504 TRIM41Q8WV44 630 aa39.44■■■■□ 3.9
KLC1-211ENST00000538504 ADAMTS12P58397 1594 aa39.4■■■■□ 3.9
KLC1-211ENST00000538504 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.4■■■■□ 3.9
KLC1-211ENST00000538504 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.4■■■■□ 3.9
KLC1-211ENST00000538504 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.4■■■■□ 3.9
KLC1-211ENST00000538504 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.4■■■■□ 3.9
KLC1-211ENST00000538504 KIF27Q86VH2 1401 aa39.37■■■■□ 3.89
KLC1-211ENST00000538504 ARHGEF11O15085 1522 aa39.35■■■■□ 3.89
KLC1-211ENST00000538504 GRIN2AQ12879 1464 aa39.34■■■■□ 3.89
KLC1-211ENST00000538504 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.33■■■■□ 3.89
KLC1-211ENST00000538504 IGF1RP08069 1367 aa39.28■■■■□ 3.88
KLC1-211ENST00000538504 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.17■■■■□ 3.86
KLC1-211ENST00000538504 CEP170Q5SW79 1584 aa39.16■■■■□ 3.86
KLC1-211ENST00000538504 NUP160Q12769 1436 aa39.15■■■■□ 3.86
KLC1-211ENST00000538504 CUL7Q14999 1698 aa39.06■■■■□ 3.84
KLC1-211ENST00000538504 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.05■■■■□ 3.84
KLC1-211ENST00000538504 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.05■■■■□ 3.84
KLC1-211ENST00000538504 ARAP1Q96P48 1450 aa39.04■■■■□ 3.84
KLC1-211ENST00000538504 JPH4Q96JJ6 628 aa38.9■■■■□ 3.82
KLC1-211ENST00000538504 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.87■■■■□ 3.81
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