Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms