Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTF1Q16619 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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