Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ITGB1BP2-201ENST00000373829 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-232ENST00000564907 3655 ntTSL 59.3□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-211ENST00000568408 879 ntTSL 59.28□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 L3MBTL2-204ENST00000452106 3282 ntTSL 29.25□□□□□ -0.933e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF788-205ENST00000596096 566 ntTSL 49.23□□□□□ -0.933e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CCDC84-204ENST00000527356 1781 ntTSL 29.22□□□□□ -0.933e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CNDP2-218ENST00000582620 525 ntTSL 59.21□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ACSS2-224ENST00000497927 580 ntTSL 49.18□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NIF3L1-202ENST00000409020 1680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.952e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TAF1B-202ENST00000402170 715 ntTSL 59.12□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCLRE1C-212ENST00000418843 901 ntTSL 59.09□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POU2F1-214ENST00000559038 557 ntTSL 49.08□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCLRE1C-201ENST00000357717 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MBD6-208ENST00000549042 533 ntTSL 49.07□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-215ENST00000569224 707 ntTSL 29.06□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 UBB-204ENST00000535788 704 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELOVL1-205ENST00000468865 797 ntTSL 39.03□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NSMCE1-203ENST00000562039 260 ntTSL 39.01□□□□□ -0.973e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CHD8-206ENST00000553870 679 ntTSL 58.96□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SIN3B-208ENST00000596638 1104 ntTSL 58.9□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ITGB1BP2-204ENST00000483897 480 ntTSL 38.89□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SNRPD2-208ENST00000590212 454 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DHX57-211ENST00000622155 5519 ntTSL 1 (best)8.85□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POLE-218ENST00000542362 508 ntTSL 48.84□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EFCAB2-211ENST00000487845 1389 ntTSL 28.82□□□□□ -13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GCLC-208ENST00000513939 519 ntTSL 28.79□□□□□ -13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC009120.2-203ENST00000565313 539 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCLRE1C-204ENST00000378246 2637 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KARS-209ENST00000568378 459 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 VTI1A-207ENST00000489357 444 ntTSL 38.63□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GMFB-209ENST00000616146 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-207ENST00000504338 751 ntTSL 38.54□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 IMPA2-206ENST00000588863 391 ntTSL 28.52□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GNB5-209ENST00000560075 817 ntTSL 58.51□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC012184.2-202ENST00000567706 867 ntTSL 58.47□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PRMT1-208ENST00000527412 463 ntTSL 38.44□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCLRE1C-205ENST00000378249 2246 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 XPC-207ENST00000511155 557 ntTSL 48.36□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NEDD1-211ENST00000557454 564 ntTSL 48.36□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.072e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CRAMP1-207ENST00000492778 573 ntTSL 48.34□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC009120.2-202ENST00000566411 679 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZBTB17-211ENST00000487785 401 ntTSL 28.3□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FBXO3-207ENST00000530013 3740 ntTSL 1 (best)8.28□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MED23-209ENST00000539158 1636 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 VTI1A-202ENST00000432306 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RPA3-205ENST00000462723 989 ntTSL 28.22□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SLC7A6-212ENST00000567325 658 ntTSL 28.2□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KARS-203ENST00000562875 801 ntTSL 38.19□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CHEK1-217ENST00000534685 583 ntTSL 58.17□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CNDP2-208ENST00000579624 1176 ntTSL 58.1□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PCCA-212ENST00000636420 1418 ntTSL 58.1□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF788-204ENST00000595703 568 ntTSL 48.08□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCLRE1C-209ENST00000378278 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MTMR14-208ENST00000431250 553 ntAPPRIS ALT2 TSL 48.06□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RPL22-202ENST00000462296 600 ntTSL 38.05□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NOMO2-208ENST00000569051 901 ntTSL 58.01□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CAPNS1-202ENST00000586851 616 ntTSL 37.97□□□□□ -1.134e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AP4M1-215ENST00000479916 485 ntTSL 37.94□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.142e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EFCAB2-207ENST00000447569 527 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POU2F1-207ENST00000442313 496 ntTSL 37.83□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCLRE1C-206ENST00000378254 2485 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NSMCE1-207ENST00000564342 625 ntTSL 37.82□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EFCAB2-216ENST00000551317 520 ntTSL 37.77□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MLXIP-207ENST00000538061 1078 ntTSL 37.76□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DNA2-202ENST00000399179 3207 ntTSL 27.74□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PHLDB1-211ENST00000527259 495 ntTSL 37.72□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NIF3L1-208ENST00000436412 479 ntTSL 37.7□□□□□ -1.182e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NIF3L1-206ENST00000416651 967 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.182e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.198e-9■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NSMCE1-205ENST00000563512 552 ntTSL 47.59□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NASP-223ENST00000534450 632 ntTSL 27.53□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TAF1B-205ENST00000434858 1592 ntTSL 27.5□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NUP98-219ENST00000532475 553 ntTSL 47.46□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CAPNS1-203ENST00000586963 570 ntTSL 27.45□□□□□ -1.224e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 STAG1-209ENST00000492318 570 ntTSL 57.45□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.239e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NSMCE1-212ENST00000567375 309 ntTSL 57.32□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ALOX12P2-211ENST00000575787 712 ntTSL 37.3□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCLRE1C-211ENST00000396817 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 VAT1-207ENST00000589828 521 ntTSL 27.22□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POU2F1-201ENST00000271411 13945 ntTSL 1 (best)7.21□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF788-201ENST00000397755 3246 ntTSL 27.18□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DHX57-206ENST00000479345 1835 ntTSL 27.07□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 41.9
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 1671.8 ms