Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA9P57773 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA9P57773 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA9P57773 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA9P57773 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA9P57773 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA9P57773 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA9P57773 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA9P57773 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA9P57773 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA9P57773 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA9P57773 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA9P57773 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA9P57773 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA9P57773 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA9P57773 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA9P57773 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA9P57773 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA9P57773 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA9P57773 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA9P57773 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms