Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GJA9P57773 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
GJA9P57773 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
GJA9P57773 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
GJA9P57773 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
GJA9P57773 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
GJA9P57773 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GJA9P57773 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
GJA9P57773 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
GJA9P57773 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
GJA9P57773 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
GJA9P57773 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GJA9P57773 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GJA9P57773 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GJA9P57773 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GJA9P57773 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GJA9P57773 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GJA9P57773 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GJA9P57773 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
GJA9P57773 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GJA9P57773 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GJA9P57773 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GJA9P57773 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
GJA9P57773 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GJA9P57773 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
GJA9P57773 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GJA9P57773 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GJA9P57773 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GJA9P57773 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
GJA9P57773 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
GJA9P57773 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
GJA9P57773 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GJA9P57773 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
GJA9P57773 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
GJA9P57773 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GJA9P57773 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GJA9P57773 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
GJA9P57773 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GJA9P57773 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GJA9P57773 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GJA9P57773 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GJA9P57773 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GJA9P57773 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GJA9P57773 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
GJA9P57773 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GJA9P57773 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GJA9P57773 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GJA9P57773 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GJA9P57773 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GJA9P57773 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GJA9P57773 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
GJA9P57773 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GJA9P57773 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GJA9P57773 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GJA9P57773 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GJA9P57773 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GJA9P57773 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
GJA9P57773 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
GJA9P57773 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GJA9P57773 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
GJA9P57773 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GJA9P57773 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
GJA9P57773 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GJA9P57773 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GJA9P57773 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GJA9P57773 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GJA9P57773 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GJA9P57773 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GJA9P57773 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GJA9P57773 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GJA9P57773 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GJA9P57773 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GJA9P57773 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GJA9P57773 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GJA9P57773 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GJA9P57773 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GJA9P57773 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GJA9P57773 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GJA9P57773 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GJA9P57773 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GJA9P57773 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GJA9P57773 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
GJA9P57773 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GJA9P57773 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
GJA9P57773 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GJA9P57773 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GJA9P57773 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GJA9P57773 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GJA9P57773 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GJA9P57773 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GJA9P57773 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GJA9P57773 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GJA9P57773 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GJA9P57773 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
GJA9P57773 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GJA9P57773 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GJA9P57773 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GJA9P57773 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GJA9P57773 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GJA9P57773 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms