Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB17Q9H0T7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB17Q9H0T7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms