Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms