Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNAPC1Q16533 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms