Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SLC35C2-210ENST00000484318 971 ntTSL 514.46□□□□□ -0.093e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 NDUFA3-205ENST00000417903 666 ntTSL 314.34□□□□□ -0.113e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.183e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.263e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.553e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 NDUFA3-210ENST00000471292 646 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.653e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 NDUFA3-209ENST00000451517 445 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.653e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 NDUFA3-202ENST00000391762 435 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.043e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC7.36□□□□□ -1.233e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 DDX18-206ENST00000489933 720 ntTSL 25.08□□□□□ -1.62e-19■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 CXXC1-205ENST00000586502 541 ntTSL 315.49■□□□□ 0.077e-10■■■■■ 35.6
PCBP2Q15366 SRRM2-212ENST00000572952 1118 ntTSL 212.22□□□□□ -0.451e-19■■■■■ 35.6
PCBP2Q15366 FOXN3-208ENST00000555034 505 ntTSL 37.08□□□□□ -1.286e-8■■■■■ 35.6
PCBP2Q15366 FOXN3-205ENST00000553904 337 ntTSL 36.07□□□□□ -1.446e-8■■■■■ 35.6
PCBP2Q15366 RPTOR-206ENST00000573746 688 ntTSL 28.84□□□□□ -0.996e-7■■■■■ 35.6
PCBP2Q15366 MKL2-210ENST00000574998 545 ntTSL 45.68□□□□□ -1.51e-10■■■■■ 35.6
PCBP2Q15366 EXOSC3-205ENST00000482614 462 ntTSL 514.36□□□□□ -0.114e-8■■■■■ 35.6
PCBP2Q15366 EXOSC3-206ENST00000489414 535 ntTSL 47.51□□□□□ -1.214e-8■■■■■ 35.6
PCBP2Q15366 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 35.6
PCBP2Q15366 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 35.6
PCBP2Q15366 SH3BP4-205ENST00000444916 570 ntTSL 413.3□□□□□ -0.285e-7■■■■■ 35.6
PCBP2Q15366 SH3BP4-206ENST00000446904 829 ntTSL 39.48□□□□□ -0.895e-7■■■■■ 35.6
PCBP2Q15366 PTK2-257ENST00000524357 535 ntTSL 419.51■□□□□ 0.716e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 PTK2-223ENST00000520828 574 ntTSL 47.55□□□□□ -1.26e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 PTK2-242ENST00000523067 488 ntTSL 47.35□□□□□ -1.236e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 PTBP2-209ENST00000482253 2029 ntTSL 218.3■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 PTBP2-202ENST00000370198 3054 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.094e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 PTBP2-207ENST00000476419 1691 ntTSL 1 (best)7.71□□□□□ -1.184e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.214e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.874e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 FLOT2-204ENST00000577789 2503 ntTSL 516.09■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 FLOT2-206ENST00000580805 2679 ntTSL 516.05■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 CORO1C-217ENST00000551550 547 ntTSL 49.33□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 35.5
PCBP2Q15366 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.696e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 ZNF148-204ENST00000471196 566 ntTSL 418.74■□□□□ 0.596e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.646e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 CCT6P3-202ENST00000426828 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.663e-8■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.996e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.256e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 DEPDC1B-202ENST00000453022 1569 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 DEPDC1B-205ENST00000512078 1596 ntTSL 27.38□□□□□ -1.239e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.319e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.128e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.28e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.218e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 RIC1-207ENST00000545641 3998 ntTSL 1 (best)3.79□□□□□ -1.88e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 RIC1-202ENST00000276898 3973 ntTSL 53.72□□□□□ -1.818e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.546e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.383e-9■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 KRIT1-205ENST00000412043 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.528e-10■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.568e-10■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 KRIT1-202ENST00000394503 2827 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.918e-10■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 KRIT1-204ENST00000394507 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.058e-10■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.188e-10■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 KRIT1-221ENST00000475770 2411 ntTSL 1 (best)7.66□□□□□ -1.188e-10■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 KRIT1-222ENST00000486261 4057 ntTSL 1 (best)4.95□□□□□ -1.628e-10■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 CCNY-208ENST00000492478 809 ntTSL 58.69□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 35.4
PCBP2Q15366 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.013e-19■■■■■ 35.3
PCBP2Q15366 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.383e-19■■■■■ 35.3
PCBP2Q15366 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 35.3
PCBP2Q15366 DTD1-203ENST00000618693 695 ntTSL 512.71□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 35.3
PCBP2Q15366 DIAPH3-205ENST00000400324 4804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 35.3
PCBP2Q15366 DIAPH3-203ENST00000400319 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 35.3
PCBP2Q15366 DIAPH3-202ENST00000377908 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 35.3
PCBP2Q15366 DIAPH3-204ENST00000400320 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 35.3
PCBP2Q15366 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.11e-7■■■■■ 35.3
PCBP2Q15366 MYH10-202ENST00000360416 7762 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 35.3
PCBP2Q15366 MYH10-201ENST00000269243 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 35.3
PCBP2Q15366 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 35.3
PCBP2Q15366 TPCN2-204ENST00000535009 2175 ntTSL 222.11■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 35.3
PCBP2Q15366 PVT1-217ENST00000523190 443 ntTSL 36.56□□□□□ -1.367e-7■■■■■ 35.3
PCBP2Q15366 PKM-209ENST00000563986 825 ntTSL 211.25□□□□□ -0.617e-32■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 PKM-205ENST00000561609 1568 ntTSL 1 (best)11.11□□□□□ -0.637e-32■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 PKM-225ENST00000570166 626 ntTSL 27.1□□□□□ -1.277e-32■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 SFXN5-203ENST00000411783 915 ntTSL 313.76□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 SFXN5-202ENST00000410065 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 SFXN5-201ENST00000272433 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 IRF2-201ENST00000393593 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.117e-8■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 GATAD2B-211ENST00000637918 1027 ntTSL 511.99□□□□□ -0.499e-11■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 FBXL19-203ENST00000427128 3312 ntTSL 1 (best)15.76■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 TCF12-210ENST00000558908 553 ntTSL 417.21■□□□□ 0.359e-7■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.282e-14■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.799e-7■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 TPD52-217ENST00000521241 723 ntTSL 520.84■□□□□ 0.934e-8■■■■■ 35.2
PCBP2Q15366 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.674e-8■■■■■ 35.2
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