Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL11A1P12107 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms