Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q1T7F1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q1T7F1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q1T7F1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q1T7F1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q1T7F1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q1T7F1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q1T7F1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q1T7F1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q1T7F1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q1T7F1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q1T7F1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q1T7F1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q1T7F1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q1T7F1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q1T7F1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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