Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATL2Q8NHH9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ATL2Q8NHH9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATL2Q8NHH9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATL2Q8NHH9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL2Q8NHH9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms