Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 ADGRV1-217ENST00000639431 611 ntTSL 55.13□□□□□ -1.591e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.851e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.043e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.12e-13■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 ANKLE2-206ENST00000538766 1557 ntTSL 213.44□□□□□ -0.262e-13■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 ANKLE2-208ENST00000542282 3302 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.592e-13■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 ANKLE2-203ENST00000505031 2861 ntTSL 310.62□□□□□ -0.712e-13■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 ANKLE2-209ENST00000542374 515 ntTSL 39.3□□□□□ -0.922e-13■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.037e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.287e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 HSPH1-206ENST00000602786 3488 ntTSL 1 (best)13.32□□□□□ -0.287e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.457e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 HSPH1-209ENST00000630972 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.817e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 HSPH1-203ENST00000435381 812 ntTSL 45.01□□□□□ -1.617e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 STK38-201ENST00000229812 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 UNK-208ENST00000592629 633 ntTSL 317.63■□□□□ 0.411e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.451e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 CAMTA2-211ENST00000574606 534 ntTSL 512.1□□□□□ -0.471e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.561e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 CAMTA2-201ENST00000348066 4491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.561e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 CAMTA2-208ENST00000572543 4496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.591e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 CAMTA2-212ENST00000574951 4431 ntTSL 511.28□□□□□ -0.61e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 CAMTA2-203ENST00000381311 4374 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.721e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 CAMTA2-209ENST00000573004 962 ntTSL 29.52□□□□□ -0.891e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 ST6GAL1-213ENST00000448449 1055 ntTSL 57.42□□□□□ -1.221e-6■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 ST6GAL1-209ENST00000442023 570 ntTSL 47.14□□□□□ -1.271e-6■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.642e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.542e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.32e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.222e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 ARID1B-218ENST00000636748 8853 ntTSL 28.65□□□□□ -1.022e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 ZCCHC11-217ENST00000524582 539 ntTSL 420.09■□□□□ 0.815e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 ZCCHC11-208ENST00000470626 883 ntTSL 319.14■□□□□ 0.655e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 ZCCHC11-210ENST00000473856 2047 ntTSL 1 (best)19.01■□□□□ 0.635e-7■■■■□ 25.4
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TARDBPQ13148 HOXB3-206ENST00000471459 565 ntTSL 414.98□□□□□ -0.015e-7■■■■□ 25.4
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TARDBPQ13148 ZCCHC11-202ENST00000355809 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.645e-7■■■■□ 25.4
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TARDBPQ13148 HOXB3-209ENST00000478644 398 ntTSL 46.34□□□□□ -1.395e-7■■■■□ 25.4
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TARDBPQ13148 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.293e-6■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.523e-6■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 GATAD2A-213ENST00000609040 1652 ntTSL 217.79■□□□□ 0.447e-8■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.297e-8■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.454e-10■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.014e-10■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.73e-7■■■■□ 25.4
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TARDBPQ13148 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 318.83■□□□□ 0.63e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 517.02■□□□□ 0.323e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.33e-7■■■■□ 25.4
TARDBPQ13148 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 515.54■□□□□ 0.083e-7■■■■□ 25.4
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TARDBPQ13148 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.422e-7■■■■□ 25.3
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TARDBPQ13148 CRADD-212ENST00000609189 772 ntTSL 515.35■□□□□ 0.052e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 CRADD-209ENST00000551065 1293 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.242e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.292e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 CRADD-207ENST00000550030 824 ntTSL 312.91□□□□□ -0.342e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 SNX11-211ENST00000582481 627 ntTSL 29.71□□□□□ -0.862e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 SNX11-205ENST00000578861 571 ntTSL 49.53□□□□□ -0.882e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 CRADD-206ENST00000549615 514 ntTSL 39.4□□□□□ -0.92e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 SNX11-206ENST00000580219 1200 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.932e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 SNX11-213ENST00000584335 922 ntTSL 58.65□□□□□ -1.022e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 SNX11-208ENST00000581298 563 ntTSL 57.17□□□□□ -1.262e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 PUM1-211ENST00000498419 3068 ntTSL 56.35□□□□□ -1.397e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.043e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.273e-14■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DLEU1-218ENST00000475913 534 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DLEU1-203ENST00000461527 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DLEU1-219ENST00000476738 838 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DLEU1-208ENST00000468168 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DLEU1-232ENST00000491341 1141 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DLEU1-207ENST00000467721 1455 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DLEU1-209ENST00000468522 1158 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.762e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DLEU1-229ENST00000486895 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DLEU1-206ENST00000463474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.892e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DLEU1-225ENST00000484529 400 ntTSL 1 (best)9.33□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DLEU1-234ENST00000491615 1451 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DLEU1-228ENST00000485007 736 ntTSL 58.59□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 56.95□□□□□ -1.32e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DHRSX-207ENST00000478825 679 ntTSL 222.69■■□□□ 1.221e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 221.83■■□□□ 1.091e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 221.09■□□□□ 0.971e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DHRSX-205ENST00000444280 797 ntTSL 217.14■□□□□ 0.331e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 27.66□□□□□ -1.181e-6■■■■□ 25.3
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