Protein–RNA interactions for Protein: P63133

ERVK-8, Endogenous retrovirus group K member 8 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-8P63133 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-8P63133 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-8P63133 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-8P63133 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK-8P63133 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-8P63133 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms