Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms