Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEMP2A6NFY4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEMP2A6NFY4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEMP2A6NFY4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms