Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.22e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.492e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.492e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 DKC1-204ENST00000426673 843 ntTSL 510.14□□□□□ -0.792e-9■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 DKC1-211ENST00000484317 671 ntTSL 210.14□□□□□ -0.792e-9■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.124e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.084e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-219ENST00000522387 2331 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.254e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-224ENST00000610907 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.624e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-216ENST00000520868 971 ntTSL 59.95□□□□□ -0.824e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-213ENST00000519848 676 ntTSL 29.24□□□□□ -0.934e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-220ENST00000522658 736 ntTSL 27.38□□□□□ -1.234e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-223ENST00000523636 818 ntTSL 57.01□□□□□ -1.294e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-204ENST00000517990 487 ntTSL 56.59□□□□□ -1.354e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-206ENST00000578479 904 ntTSL 310.71□□□□□ -0.695e-7■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-210ENST00000580567 899 ntTSL 310.71□□□□□ -0.695e-7■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.891e-8■□□□□ 10.6
UTP3Q9NQZ2 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.081e-8■□□□□ 10.6
UTP3Q9NQZ2 CANX-206ENST00000503126 592 ntTSL 57.62□□□□□ -1.193e-6■□□□□ 10.6
UTP3Q9NQZ2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.65■□□□□ 0.741e-7■□□□□ 10.6
UTP3Q9NQZ2 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.27□□□□□ -1.573e-6■□□□□ 10.5
UTP3Q9NQZ2 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.59□□□□□ -1.673e-6■□□□□ 10.5
UTP3Q9NQZ2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.58■□□□□ 0.561e-323■□□□□ 10.5
UTP3Q9NQZ2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.541e-323■□□□□ 10.5
UTP3Q9NQZ2 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 NAP1L1-211ENST00000547969 543 ntTSL 48.38□□□□□ -1.071e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.447e-8■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 CBX3-204ENST00000456948 1068 ntTSL 524.64■■□□□ 1.549e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.579e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.499e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.249e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.139e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 SDHA-210ENST00000509420 580 ntTSL 214.16□□□□□ -0.149e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 DENND4B-206ENST00000474386 455 ntTSL 312.47□□□□□ -0.419e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 LRRC41-204ENST00000496156 892 ntTSL 512.03□□□□□ -0.489e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 CDC20-204ENST00000482046 422 ntTSL 211.16□□□□□ -0.629e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 KIF18A-204ENST00000533466 1816 ntTSL 510.11□□□□□ -0.799e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 KIF18A-202ENST00000526288 744 ntTSL 210.07□□□□□ -0.89e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.959e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 NASP-221ENST00000531612 938 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.98□□□□□ -0.979e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 NASP-218ENST00000530073 2740 ntTSL 28.32□□□□□ -1.089e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 NASP-210ENST00000481782 3659 ntTSL 27.97□□□□□ -1.139e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 NASP-223ENST00000534450 632 ntTSL 27.95□□□□□ -1.149e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 NASP-214ENST00000527932 650 ntTSL 37.26□□□□□ -1.259e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.339e-7■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 MMADHC-201ENST00000303319 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.559e-7■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 MMADHC-202ENST00000422782 1462 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.069e-7■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL11-202ENST00000443624 994 ntTSL 28.31□□□□□ -1.084e-10■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.443e-6■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 FIS1-208ENST00000480497 530 ntTSL 317.8■□□□□ 0.443e-6■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 FIS1-209ENST00000482199 731 ntTSL 317.8■□□□□ 0.443e-6■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 FIS1-204ENST00000449367 745 ntTSL 217.52■□□□□ 0.43e-6■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.133e-6■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 FIS1-205ENST00000463406 527 ntTSL 39.59□□□□□ -0.873e-6■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-203ENST00000426651 1057 ntTSL 520.95■□□□□ 0.941e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-209ENST00000496554 947 ntTSL 219■□□□□ 0.631e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-205ENST00000468019 941 ntTSL 213.83□□□□□ -0.21e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-206ENST00000485706 743 ntTSL 213.37□□□□□ -0.271e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-207ENST00000489392 966 ntTSL 511.17□□□□□ -0.621e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-201ENST00000315731 680 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.911e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-204ENST00000463740 1164 ntTSL 57.63□□□□□ -1.191e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.231e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.23□□□□□ -1.891e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPA2B1-207ENST00000495810 482 ntTSL 211.12□□□□□ -0.632e-10■□□□□ 10.1
UTP3Q9NQZ2 ESYT1-206ENST00000550515 716 ntTSL 213.52□□□□□ -0.255e-6■□□□□ 10.1
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-210ENST00000580573 556 ntTSL 38.5□□□□□ -1.052e-7■□□□□ 10.1
UTP3Q9NQZ2 HNRNPD-208ENST00000509263 782 ntTSL 59.36□□□□□ -0.912e-7■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-222ENST00000534319 1884 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.242e-7■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-215ENST00000532091 2301 ntTSL 513.25□□□□□ -0.292e-7■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-203ENST00000524552 963 ntTSL 1 (best)13.14□□□□□ -0.312e-7■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-201ENST00000227378 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.312e-7■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-207ENST00000526110 1924 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.352e-7■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-208ENST00000526686 740 ntTSL 1 (best)5.45□□□□□ -1.542e-7■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.319e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 SNHG22-202ENST00000615535 421 nt16.04■□□□□ 0.169e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.579e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 MALAT1-204ENST00000610481 353 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-323■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC11.48□□□□□ -0.571e-323■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.021e-323■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.144e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.224e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-205ENST00000472628 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.494e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-202ENST00000394935 580 ntTSL 310.41□□□□□ -0.744e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-201ENST00000355731 587 ntTSL 510.14□□□□□ -0.794e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.14e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-207ENST00000578181 593 ntTSL 25.7□□□□□ -1.54e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.625e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 SSB-206ENST00000461708 619 ntTSL 218.83■□□□□ 0.65e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.55e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 SSB-204ENST00000417292 545 ntTSL 314.49□□□□□ -0.095e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 SSB-203ENST00000413002 674 ntTSL 314.12□□□□□ -0.155e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 SSB-205ENST00000422006 2463 ntTSL 510.24□□□□□ -0.775e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.126e-68■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 NONO-206ENST00000420903 622 ntTSL 36.57□□□□□ -1.364e-11■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 NONO-207ENST00000450092 491 ntTSL 56.28□□□□□ -1.44e-11■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 NONO-213ENST00000486613 555 ntTSL 24.45□□□□□ -1.74e-11■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 PSAP-203ENST00000493143 576 ntTSL 212.83□□□□□ -0.361e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 PSAP-206ENST00000633965 500 ntTSL 58.3□□□□□ -1.081e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 DDIT4-202ENST00000471240 521 ntTSL 222.9■■□□□ 1.264e-7■□□□□ 9.8
UTP3Q9NQZ2 CALM2-207ENST00000484408 682 ntTSL 522.26■■□□□ 1.156e-10■□□□□ 9.6
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3733.8 ms