Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.22e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.492e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.492e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 DKC1-204ENST00000426673 843 ntTSL 510.14□□□□□ -0.792e-9■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 DKC1-211ENST00000484317 671 ntTSL 210.14□□□□□ -0.792e-9■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.124e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.084e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-219ENST00000522387 2331 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.254e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-224ENST00000610907 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.624e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-216ENST00000520868 971 ntTSL 59.95□□□□□ -0.824e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-213ENST00000519848 676 ntTSL 29.24□□□□□ -0.934e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-220ENST00000522658 736 ntTSL 27.38□□□□□ -1.234e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-223ENST00000523636 818 ntTSL 57.01□□□□□ -1.294e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 PABPC1-204ENST00000517990 487 ntTSL 56.59□□□□□ -1.354e-12■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-206ENST00000578479 904 ntTSL 310.71□□□□□ -0.695e-7■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-210ENST00000580567 899 ntTSL 310.71□□□□□ -0.695e-7■□□□□ 10.7
UTP3Q9NQZ2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.891e-8■□□□□ 10.6
UTP3Q9NQZ2 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.081e-8■□□□□ 10.6
UTP3Q9NQZ2 CANX-206ENST00000503126 592 ntTSL 57.62□□□□□ -1.193e-6■□□□□ 10.6
UTP3Q9NQZ2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.65■□□□□ 0.741e-7■□□□□ 10.6
UTP3Q9NQZ2 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.27□□□□□ -1.573e-6■□□□□ 10.5
UTP3Q9NQZ2 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.59□□□□□ -1.673e-6■□□□□ 10.5
UTP3Q9NQZ2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.58■□□□□ 0.561e-323■□□□□ 10.5
UTP3Q9NQZ2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.541e-323■□□□□ 10.5
UTP3Q9NQZ2 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 NAP1L1-211ENST00000547969 543 ntTSL 48.38□□□□□ -1.071e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.447e-8■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 CBX3-204ENST00000456948 1068 ntTSL 524.64■■□□□ 1.549e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.579e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.499e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.249e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.139e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 SDHA-210ENST00000509420 580 ntTSL 214.16□□□□□ -0.149e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 DENND4B-206ENST00000474386 455 ntTSL 312.47□□□□□ -0.419e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 LRRC41-204ENST00000496156 892 ntTSL 512.03□□□□□ -0.489e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 CDC20-204ENST00000482046 422 ntTSL 211.16□□□□□ -0.629e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 KIF18A-204ENST00000533466 1816 ntTSL 510.11□□□□□ -0.799e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 KIF18A-202ENST00000526288 744 ntTSL 210.07□□□□□ -0.89e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.959e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 NASP-221ENST00000531612 938 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.98□□□□□ -0.979e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 NASP-218ENST00000530073 2740 ntTSL 28.32□□□□□ -1.089e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 NASP-210ENST00000481782 3659 ntTSL 27.97□□□□□ -1.139e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 NASP-223ENST00000534450 632 ntTSL 27.95□□□□□ -1.149e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 NASP-214ENST00000527932 650 ntTSL 37.26□□□□□ -1.259e-6■□□□□ 10.3
UTP3Q9NQZ2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.339e-7■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 MMADHC-201ENST00000303319 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.559e-7■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 MMADHC-202ENST00000422782 1462 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.069e-7■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL11-202ENST00000443624 994 ntTSL 28.31□□□□□ -1.084e-10■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.443e-6■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 FIS1-208ENST00000480497 530 ntTSL 317.8■□□□□ 0.443e-6■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 FIS1-209ENST00000482199 731 ntTSL 317.8■□□□□ 0.443e-6■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 FIS1-204ENST00000449367 745 ntTSL 217.52■□□□□ 0.43e-6■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.133e-6■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 FIS1-205ENST00000463406 527 ntTSL 39.59□□□□□ -0.873e-6■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-203ENST00000426651 1057 ntTSL 520.95■□□□□ 0.941e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-209ENST00000496554 947 ntTSL 219■□□□□ 0.631e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-205ENST00000468019 941 ntTSL 213.83□□□□□ -0.21e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-206ENST00000485706 743 ntTSL 213.37□□□□□ -0.271e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-207ENST00000489392 966 ntTSL 511.17□□□□□ -0.621e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-201ENST00000315731 680 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.911e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-204ENST00000463740 1164 ntTSL 57.63□□□□□ -1.191e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.231e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.23□□□□□ -1.891e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPA2B1-207ENST00000495810 482 ntTSL 211.12□□□□□ -0.632e-10■□□□□ 10.1
UTP3Q9NQZ2 ESYT1-206ENST00000550515 716 ntTSL 213.52□□□□□ -0.255e-6■□□□□ 10.1
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-210ENST00000580573 556 ntTSL 38.5□□□□□ -1.052e-7■□□□□ 10.1
UTP3Q9NQZ2 HNRNPD-208ENST00000509263 782 ntTSL 59.36□□□□□ -0.912e-7■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-222ENST00000534319 1884 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.242e-7■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-215ENST00000532091 2301 ntTSL 513.25□□□□□ -0.292e-7■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-203ENST00000524552 963 ntTSL 1 (best)13.14□□□□□ -0.312e-7■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-201ENST00000227378 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.312e-7■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-207ENST00000526110 1924 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.352e-7■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-208ENST00000526686 740 ntTSL 1 (best)5.45□□□□□ -1.542e-7■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.319e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 SNHG22-202ENST00000615535 421 nt16.04■□□□□ 0.169e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.579e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 MALAT1-204ENST00000610481 353 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-323■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC11.48□□□□□ -0.571e-323■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.021e-323■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.144e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.224e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-205ENST00000472628 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.494e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-202ENST00000394935 580 ntTSL 310.41□□□□□ -0.744e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-201ENST00000355731 587 ntTSL 510.14□□□□□ -0.794e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.14e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-207ENST00000578181 593 ntTSL 25.7□□□□□ -1.54e-8■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.625e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 SSB-206ENST00000461708 619 ntTSL 218.83■□□□□ 0.65e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.55e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 SSB-204ENST00000417292 545 ntTSL 314.49□□□□□ -0.095e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 SSB-203ENST00000413002 674 ntTSL 314.12□□□□□ -0.155e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 SSB-205ENST00000422006 2463 ntTSL 510.24□□□□□ -0.775e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.126e-68■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 NONO-206ENST00000420903 622 ntTSL 36.57□□□□□ -1.364e-11■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 NONO-207ENST00000450092 491 ntTSL 56.28□□□□□ -1.44e-11■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 NONO-213ENST00000486613 555 ntTSL 24.45□□□□□ -1.74e-11■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 PSAP-203ENST00000493143 576 ntTSL 212.83□□□□□ -0.361e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 PSAP-206ENST00000633965 500 ntTSL 58.3□□□□□ -1.081e-6■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 DDIT4-202ENST00000471240 521 ntTSL 222.9■■□□□ 1.264e-7■□□□□ 9.8
UTP3Q9NQZ2 CALM2-207ENST00000484408 682 ntTSL 522.26■■□□□ 1.156e-10■□□□□ 9.6
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