RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471240.1

DDIT4-202, DNA damage inducible transcript 4, humanhuman

TSL 2

Gene DDIT4, Length 521 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4-202ENST00000471240 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.25■■■■■ 5.95
DDIT4-202ENST00000471240 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.49■■■■■ 5.03
DDIT4-202ENST00000471240 ABCC9O60706 1549 aa46.18■■■■■ 4.98
DDIT4-202ENST00000471240 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.3■■■■■ 4.68
DDIT4-202ENST00000471240 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.09■■■■■ 4.65
DDIT4-202ENST00000471240 NACADO15069 1562 aa43.9■■■■■ 4.62
DDIT4-202ENST00000471240 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.53
DDIT4-202ENST00000471240 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.38■■■■■ 4.53
DDIT4-202ENST00000471240 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.22■■■■■ 4.51
DDIT4-202ENST00000471240 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.07■■■■■ 4.48
DDIT4-202ENST00000471240 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.96■■■■■ 4.47
DDIT4-202ENST00000471240 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.77■■■■■ 4.44
DDIT4-202ENST00000471240 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.69■■■■■ 4.43
DDIT4-202ENST00000471240 SCRIBQ14160 1630 aa42.61■■■■■ 4.41
DDIT4-202ENST00000471240 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.13■■■■■ 4.34
DDIT4-202ENST00000471240 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
DDIT4-202ENST00000471240 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.63■■■■■ 4.26
DDIT4-202ENST00000471240 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.5■■■■■ 4.23
DDIT4-202ENST00000471240 SMARCA4P51532 1647 aa40.6■■■■■ 4.09
DDIT4-202ENST00000471240 NCAPD3P42695 1498 aa40.53■■■■■ 4.08
DDIT4-202ENST00000471240 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.53■■■■■ 4.08
DDIT4-202ENST00000471240 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
DDIT4-202ENST00000471240 SMARCA2P51531 1590 aa40.44■■■■■ 4.06
DDIT4-202ENST00000471240 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.29■■■■■ 4.04
DDIT4-202ENST00000471240 HMGXB3Q12766 1538 aa40.24■■■■■ 4.03
DDIT4-202ENST00000471240 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
DDIT4-202ENST00000471240 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.1■■■■■ 4.01
DDIT4-202ENST00000471240 ERCC6Q03468 1493 aa39.88■■■■□ 3.98
DDIT4-202ENST00000471240 WIZO95785 1651 aa39.84■■■■□ 3.97
DDIT4-202ENST00000471240 NESP48681 1621 aa39.8■■■■□ 3.96
DDIT4-202ENST00000471240 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
DDIT4-202ENST00000471240 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.51■■■■□ 3.92
DDIT4-202ENST00000471240 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.43■■■■□ 3.9
DDIT4-202ENST00000471240 CUX2O14529 1486 aa39.43■■■■□ 3.9
DDIT4-202ENST00000471240 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.4■■■■□ 3.9
DDIT4-202ENST00000471240 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
DDIT4-202ENST00000471240 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.2■■■■□ 3.87
DDIT4-202ENST00000471240 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
DDIT4-202ENST00000471240 CFTRP13569 1480 aa39.02■■■■□ 3.84
DDIT4-202ENST00000471240 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.98■■■■□ 3.83
DDIT4-202ENST00000471240 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.98■■■■□ 3.83
DDIT4-202ENST00000471240 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.97■■■■□ 3.83
DDIT4-202ENST00000471240 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.96■■■■□ 3.83
DDIT4-202ENST00000471240 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.84■■■■□ 3.81
DDIT4-202ENST00000471240 WDR62O43379 1518 aa38.76■■■■□ 3.8
DDIT4-202ENST00000471240 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
DDIT4-202ENST00000471240 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
DDIT4-202ENST00000471240 PRDM2Q13029 1718 aa38.55■■■■□ 3.76
DDIT4-202ENST00000471240 TOPBP1Q92547 1522 aa38.27■■■■□ 3.72
DDIT4-202ENST00000471240 ABCC8Q09428 1581 aa38.23■■■■□ 3.71
DDIT4-202ENST00000471240 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.15■■■■□ 3.7
DDIT4-202ENST00000471240 IFT140Q96RY7 1462 aa38.14■■■■□ 3.7
DDIT4-202ENST00000471240 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
DDIT4-202ENST00000471240 OSCARQ8IYS5 282 aa37.93■■■■□ 3.66
DDIT4-202ENST00000471240 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
DDIT4-202ENST00000471240 SOGA1O94964 1423 aa37.86■■■■□ 3.65
DDIT4-202ENST00000471240 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.84■■■■□ 3.65
DDIT4-202ENST00000471240 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.83■■■■□ 3.652e-24■■■■■ 61.6
DDIT4-202ENST00000471240 CUX1P39880 1505 aa37.82■■■■□ 3.64
DDIT4-202ENST00000471240 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.79■■■■□ 3.64
DDIT4-202ENST00000471240 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
DDIT4-202ENST00000471240 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
DDIT4-202ENST00000471240 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
DDIT4-202ENST00000471240 FBLN2P98095 1184 aa37.68■■■■□ 3.62
DDIT4-202ENST00000471240 TRIM41Q8WV44 630 aa37.61■■■■□ 3.61
DDIT4-202ENST00000471240 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.49■■■■□ 3.59
DDIT4-202ENST00000471240 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.42■■■■□ 3.58
DDIT4-202ENST00000471240 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
DDIT4-202ENST00000471240 WDR97A6NE52 1622 aa37.4■■■■□ 3.58
DDIT4-202ENST00000471240 GRIN2BQ13224 1484 aa37.39■■■■□ 3.58
DDIT4-202ENST00000471240 CHD1O14646 1710 aa37.39■■■■□ 3.58
DDIT4-202ENST00000471240 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.36■■■■□ 3.57
DDIT4-202ENST00000471240 SYNJ1O43426 1573 aa37.34■■■■□ 3.57
DDIT4-202ENST00000471240 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.34■■■■□ 3.57
DDIT4-202ENST00000471240 TOP2BQ02880 1626 aa37.33■■■■□ 3.57
DDIT4-202ENST00000471240 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.28■■■■□ 3.56
DDIT4-202ENST00000471240 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
DDIT4-202ENST00000471240 PBRM1Q86U86 1689 aa37.19■■■■□ 3.54
DDIT4-202ENST00000471240 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.19■■■■□ 3.54
DDIT4-202ENST00000471240 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.19■■■■□ 3.54
DDIT4-202ENST00000471240 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.19■■■■□ 3.54
DDIT4-202ENST00000471240 SYNJ2O15056 1496 aa37.18■■■■□ 3.54
DDIT4-202ENST00000471240 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.17■■■■□ 3.54
DDIT4-202ENST00000471240 ARHGEF11O15085 1522 aa37.15■■■■□ 3.54
DDIT4-202ENST00000471240 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.07■■■■□ 3.52
DDIT4-202ENST00000471240 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.93■■■■□ 3.5
DDIT4-202ENST00000471240 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.9■■■■□ 3.5
DDIT4-202ENST00000471240 GRIN2AQ12879 1464 aa36.88■■■■□ 3.5
DDIT4-202ENST00000471240 ADAMTS12P58397 1594 aa36.88■■■■□ 3.49
DDIT4-202ENST00000471240 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.88■■■■□ 3.49
DDIT4-202ENST00000471240 ARAP1Q96P48 1450 aa36.82■■■■□ 3.49
DDIT4-202ENST00000471240 KIF27Q86VH2 1401 aa36.76■■■■□ 3.48
DDIT4-202ENST00000471240 CEP170Q5SW79 1584 aa36.69■■■■□ 3.46
DDIT4-202ENST00000471240 NUP160Q12769 1436 aa36.68■■■■□ 3.46
DDIT4-202ENST00000471240 IGF1RP08069 1367 aa36.65■■■■□ 3.46
DDIT4-202ENST00000471240 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
DDIT4-202ENST00000471240 JPH4Q96JJ6 628 aa36.51■■■■□ 3.44
DDIT4-202ENST00000471240 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.49■■■■□ 3.43
DDIT4-202ENST00000471240 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.47■■■■□ 3.43
DDIT4-202ENST00000471240 CUL7Q14999 1698 aa36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms