Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUBP2Q9Y5Y2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms