Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms