Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 PANK2-202ENST00000336066 1843 ntTSL 1 (best)24.12■■□□□ 1.451e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.911e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.561e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 RBM39-204ENST00000374038 1026 ntTSL 515.46■□□□□ 0.073e-7■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 TLK1-204ENST00000413010 603 ntTSL 516.88■□□□□ 0.291e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 TLK1-203ENST00000409443 2783 ntTSL 215.13■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.341e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.671e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.817e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 NCBP2-202ENST00000411704 564 ntTSL 515.96■□□□□ 0.157e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.087e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 ZNF562-203ENST00000585350 577 ntTSL 515.2■□□□□ 0.024e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 NCBP2-211ENST00000468923 1096 ntTSL 214.32□□□□□ -0.127e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.137e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.227e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 NCBP2-205ENST00000428425 2220 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.327e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 NCBP2-213ENST00000482976 669 ntTSL 213.01□□□□□ -0.337e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 NCBP2-201ENST00000321256 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.57e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 NCBP2-212ENST00000479647 552 ntTSL 311.36□□□□□ -0.597e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 CWF19L1-206ENST00000478047 2694 ntTSL 210□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 CWF19L1-204ENST00000468709 2402 ntTSL 29.4□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 ZNF562-208ENST00000590155 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.074e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 ZNF562-207ENST00000589542 491 ntTSL 37.48□□□□□ -1.214e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 NCBP2-209ENST00000463783 4161 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.217e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 NCBP2-208ENST00000455953 548 ntTSL 57.15□□□□□ -1.267e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 ZNF562-206ENST00000588653 585 ntTSL 26.56□□□□□ -1.364e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.374e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 CWF19L1-207ENST00000482452 1606 ntTSL 56.25□□□□□ -1.413e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 ZNF562-204ENST00000585688 1475 ntTSL 25.2□□□□□ -1.584e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 CUL3-210ENST00000484081 588 ntTSL 25.17□□□□□ -1.583e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.624e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.814e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 422.76■■□□□ 1.232e-9■■■■□ 21.1
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ILF3Q12906 FARS2-204ENST00000602691 562 ntTSL 316.47■□□□□ 0.232e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.022e-9■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.12e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-8■■■■□ 21.1
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ILF3Q12906 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.492e-8■■■■□ 21.1
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ILF3Q12906 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.822e-8■■■■□ 21.1
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ILF3Q12906 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 POLR3E-206ENST00000563282 448 ntTSL 25□□□□□ -1.611e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.535e-7■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.295e-7■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.195e-7■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.165e-7■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.055e-7■■■■□ 21.1
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ILF3Q12906 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.565e-7■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 UBE2Z-202ENST00000504684 598 ntTSL 45.23□□□□□ -1.575e-7■■■■□ 21.1
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ILF3Q12906 SPIDR-212ENST00000519661 1035 ntTSL 211.41□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 SPIDR-217ENST00000522117 2745 ntTSL 211.25□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 SPIDR-211ENST00000519401 2090 ntTSL 210.77□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.762e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 SPIDR-222ENST00000524006 970 ntTSL 510.27□□□□□ -0.772e-6■■■■□ 21.1
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ILF3Q12906 SPIDR-224ENST00000524126 2614 ntTSL 1 (best)9.37□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 SPIDR-213ENST00000521214 3577 ntTSL 27.54□□□□□ -1.22e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 SPIDR-223ENST00000524033 1023 ntTSL 27.14□□□□□ -1.272e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 FAM129A-203ENST00000461167 904 ntTSL 310.64□□□□□ -0.719e-11■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.899e-11■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 FAM129A-204ENST00000487074 3118 ntTSL 59.44□□□□□ -0.99e-11■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.372e-7■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.068e-9■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 EMC3-AS1-201ENST00000326237 2882 ntTSL 29.55□□□□□ -0.888e-9■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 EMC3-AS1-206ENST00000440568 558 ntTSL 44.56□□□□□ -1.688e-9■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 EMC3-AS1-203ENST00000424904 433 ntTSL 33.97□□□□□ -1.778e-9■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 COBLL1-219ENST00000491126 604 ntTSL 417.96■□□□□ 0.473e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.423e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 COBLL1-212ENST00000456171 1793 ntTSL 216.21■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 COBLL1-204ENST00000409184 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.51□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.083e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.325e-8■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.633e-7■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.013e-7■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 MAU2-216ENST00000609122 551 ntTSL 419.94■□□□□ 0.784e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 MAU2-205ENST00000586189 590 ntTSL 515.46■□□□□ 0.074e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.034e-6■■■■□ 21.1
ILF3Q12906 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.393e-18■■■■□ 21
ILF3Q12906 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.753e-18■■■■□ 21
ILF3Q12906 KDM2A-214ENST00000532436 605 ntTSL 39.08□□□□□ -0.965e-6■■■■□ 21
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