Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPB1Q06547 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms