Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA6L4A6NEF3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L4A6NEF3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms