Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMIM30A4D0T7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM30A4D0T7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms