Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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