Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM54Q9BYV2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms