Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 METTL13-204ENST00000466643 841 ntTSL 215.33■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PC-207ENST00000528403 706 ntTSL 215.32■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LRRC14-203ENST00000527730 978 ntTSL 215.29■□□□□ 0.049e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ACAD8-208ENST00000526026 1336 ntTSL 215.27■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CARS2-204ENST00000471986 218 ntTSL 515.27■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PLOD3-202ENST00000414785 539 ntTSL 515.26■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX41-214ENST00000512334 686 ntTSL 215.26■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-235ENST00000601247 458 ntTSL 415.18■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TEAD2-207ENST00000598397 581 ntTSL 515.16■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RNASEH2A-204ENST00000593017 1487 ntTSL 215.13■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-238ENST00000565505 602 ntTSL 515.12■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MBD3-206ENST00000589901 740 ntTSL 215.11■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 B3GNTL1-205ENST00000571394 774 ntTSL 315.09■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARHGEF39-206ENST00000490970 1270 ntTSL 515.09■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CHEK1-207ENST00000525396 769 ntTSL 215.08■□□□□ 03e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 03e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SLC26A11-205ENST00000571176 845 ntTSL 315.06■□□□□ 03e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -03e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LIN9-203ENST00000366808 3186 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -09e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RPL35-205ENST00000495728 649 ntTSL 215.04■□□□□ -03e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LAD1-208ENST00000633953 589 ntAPPRIS P1 TSL 415.02■□□□□ -03e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 STIP1-210ENST00000540887 877 ntTSL 215.01□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CRAMP1-204ENST00000466562 534 ntTSL 414.99□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AP4M1-209ENST00000445208 1681 ntTSL 514.96□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 UTP4-213ENST00000568448 562 ntTSL 414.94□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CHEK1-209ENST00000527013 661 ntTSL 314.93□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-206ENST00000503447 585 ntTSL 314.92□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ANGEL1-206ENST00000557497 577 ntTSL 214.87□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MTMR14-204ENST00000414996 1746 ntTSL 1 (best)14.86□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TFAP4-206ENST00000575320 6491 ntTSL 214.85□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SRPRB-204ENST00000484684 512 ntTSL 214.81□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 L3MBTL2-208ENST00000481902 2432 ntTSL 214.79□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RAC3-203ENST00000584341 730 ntTSL 514.78□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NAGK-225ENST00000529236 463 ntTSL 514.72□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PHLDB1-228ENST00000621027 1318 ntTSL 214.71□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RNASEH2A-205ENST00000639767 647 ntTSL 514.69□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PLOD3-216ENST00000489927 562 ntTSL 214.69□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARHGEF39-205ENST00000490638 4498 ntTSL 1 (best)14.68□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-210ENST00000568008 818 ntTSL 214.68□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MBD6-209ENST00000549231 538 ntTSL 414.67□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PXMP2-204ENST00000539093 516 ntTSL 314.66□□□□□ -0.062e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PGS1-206ENST00000586510 567 ntTSL 514.65□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-220ENST00000563007 804 ntTSL 514.63□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 B3GNTL1-208ENST00000572977 2446 ntTSL 214.57□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-209ENST00000561988 1016 ntTSL 314.53□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELOVL1-208ENST00000478481 564 ntTSL 214.5□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 WDR81-209ENST00000468539 562 ntTSL 414.49□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CEP164-205ENST00000528706 1407 ntTSL 214.49□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GNB5-212ENST00000561313 586 ntTSL 414.44□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARPC5L-203ENST00000465124 1877 ntTSL 214.44□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ATP13A2-209ENST00000506174 573 ntTSL 514.43□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NUP50-209ENST00000432340 551 ntTSL 514.42□□□□□ -0.12e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELOVL1-203ENST00000464204 1034 ntTSL 1 (best)14.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TEAD2-206ENST00000596757 579 ntTSL 514.42□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.12e-15■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NUMA1-229ENST00000545721 2796 ntTSL 514.39□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CERCAM-205ENST00000420512 887 ntTSL 314.38□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NEDD1-207ENST00000555114 731 ntTSL 314.38□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PLOD3-207ENST00000456079 563 ntTSL 414.38□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 JADE2-209ENST00000512386 567 ntTSL 414.38□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TBL2-213ENST00000459913 2358 ntTSL 514.38□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EXOC2-203ENST00000475028 536 ntTSL 414.37□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AIFM3-216ENST00000486003 2850 ntTSL 214.34□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-247ENST00000566271 944 ntTSL 514.34□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-207ENST00000595023 1131 ntTSL 514.33□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-227ENST00000598960 534 ntTSL 414.33□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARHGEF39-203ENST00000475323 2862 ntTSL 214.32□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PLA2G6-218ENST00000454670 741 ntTSL 314.3□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 UBB-206ENST00000577958 376 ntTSL 214.3□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NGEF-209ENST00000489127 590 ntTSL 514.27□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 41.9
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