Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP8P40818 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP8P40818 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP8P40818 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP8P40818 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP8P40818 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP8P40818 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP8P40818 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP8P40818 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP8P40818 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP8P40818 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP8P40818 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP8P40818 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP8P40818 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP8P40818 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP8P40818 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP8P40818 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP8P40818 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP8P40818 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP8P40818 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP8P40818 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP8P40818 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP8P40818 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP8P40818 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP8P40818 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP8P40818 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP8P40818 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP8P40818 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP8P40818 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP8P40818 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP8P40818 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP8P40818 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP8P40818 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP8P40818 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP8P40818 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP8P40818 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP8P40818 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP8P40818 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms