Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.45e-23■■■■□ 26.5
RPS3P23396 HIST1H2BJ-203ENST00000607124 950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.86e-13■■■■□ 26.5
RPS3P23396 LAMTOR5-205ENST00000531779 569 ntTSL 221.52■■□□□ 1.047e-7■■■■□ 26.5
RPS3P23396 CPVL-210ENST00000455893 561 ntTSL 52.87□□□□□ -1.954e-7■■■■□ 26.5
RPS3P23396 ECH1-211ENST00000598707 882 ntTSL 216.59■□□□□ 0.251e-7■■■■□ 26.5
RPS3P23396 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.074e-8■■■■□ 26.5
RPS3P23396 GSN-214ENST00000485767 6454 ntTSL 1 (best)10.39□□□□□ -0.759e-16■■■■□ 26.5
RPS3P23396 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.422e-9■■■■□ 26.5
RPS3P23396 IDH3B-208ENST00000479376 436 ntTSL 211.26□□□□□ -0.611e-6■■■■□ 26.5
RPS3P23396 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.034e-6■■■■□ 26.5
RPS3P23396 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.174e-6■■■■□ 26.5
RPS3P23396 DGAT2-203ENST00000603276 747 ntTSL 510.07□□□□□ -0.84e-6■■■■□ 26.5
RPS3P23396 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.571e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 510.95□□□□□ -0.663e-10■■■■□ 26.4
RPS3P23396 LYZ-201ENST00000261267 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.043e-40■■■■□ 26.4
RPS3P23396 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.913e-40■■■■□ 26.4
RPS3P23396 GANAB-212ENST00000534419 640 ntTSL 410.2□□□□□ -0.786e-9■■■■□ 26.4
RPS3P23396 PGC-204ENST00000425343 1152 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.415e-12■■■■□ 26.4
RPS3P23396 ANGPTL8-202ENST00000587543 432 ntTSL 1 (best)13.2□□□□□ -0.39e-8■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SPTAN1-206ENST00000475367 2237 ntTSL 29.73□□□□□ -0.854e-7■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SPTAN1-215ENST00000628867 579 ntTSL 27.09□□□□□ -1.274e-7■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SLC37A4-206ENST00000525372 1388 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.352e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SLC37A4-204ENST00000525039 1780 ntTSL 1 (best)16.77■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SLC37A4-211ENST00000529510 850 ntTSL 516.67■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.162e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SLC37A4-212ENST00000530407 1472 ntTSL 215.95■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SLC37A4-213ENST00000532085 5862 ntTSL 1 (best)15.87■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SLC37A4-205ENST00000525102 2844 ntTSL 213.83□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SLC37A4-219ENST00000638360 1912 ntTSL 513.68□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SLC37A4-220ENST00000638925 2046 ntTSL 513.48□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SLC37A4-218ENST00000638186 2074 ntTSL 513.36□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SLC37A4-210ENST00000527992 2040 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SLC37A4-203ENST00000524428 1526 ntTSL 1 (best)11.11□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 26.4
RPS3P23396 HSPA8-223ENST00000534567 588 ntTSL 43.59□□□□□ -1.832e-10■■■■□ 26.4
RPS3P23396 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.311e-8■■■■□ 26.4
RPS3P23396 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.11e-8■■■■□ 26.4
RPS3P23396 EIF4A1-218ENST00000581544 1444 ntTSL 211.34□□□□□ -0.591e-8■■■■□ 26.4
RPS3P23396 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.691e-8■■■■□ 26.4
RPS3P23396 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.711e-8■■■■□ 26.4
RPS3P23396 EIF4A1-202ENST00000396527 1169 ntTSL 27.7□□□□□ -1.181e-8■■■■□ 26.4
RPS3P23396 LMNA-222ENST00000508500 848 ntTSL 1 (best)15.61■□□□□ 0.091e-9■■■■□ 26.3
RPS3P23396 SEZ6L2-205ENST00000562159 764 ntTSL 314.09□□□□□ -0.154e-8■■■■□ 26.3
RPS3P23396 CTSH-214ENST00000534038 593 ntTSL 418.21■□□□□ 0.514e-9■■■■□ 26.3
RPS3P23396 APOBEC3C-201ENST00000361441 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.713e-7■■■■□ 26.3
RPS3P23396 APOBEC3C-202ENST00000428892 1056 ntTSL 310.5□□□□□ -0.733e-7■■■■□ 26.3
RPS3P23396 AL022318.4-201ENST00000381568 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.793e-7■■■■□ 26.3
RPS3P23396 NARS-203ENST00000540592 937 ntTSL 211.78□□□□□ -0.527e-7■■■■□ 26.3
RPS3P23396 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.873e-13■■■■□ 26.3
RPS3P23396 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.783e-13■■■■□ 26.3
RPS3P23396 USP39-218ENST00000493829 1660 ntTSL 219.11■□□□□ 0.653e-13■■■■□ 26.3
RPS3P23396 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.63e-13■■■■□ 26.3
RPS3P23396 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.513e-13■■■■□ 26.3
RPS3P23396 USP39-209ENST00000458268 751 ntTSL 418.13■□□□□ 0.493e-13■■■■□ 26.3
RPS3P23396 USP39-208ENST00000455732 623 ntTSL 316.9■□□□□ 0.33e-13■■■■□ 26.3
RPS3P23396 USP39-211ENST00000465282 568 ntTSL 416.66■□□□□ 0.263e-13■■■■□ 26.3
RPS3P23396 USP39-205ENST00000442708 561 ntTSL 415.71■□□□□ 0.113e-13■■■■□ 26.3
RPS3P23396 USP39-217ENST00000491659 648 ntTSL 314.63□□□□□ -0.073e-13■■■■□ 26.3
RPS3P23396 USP39-206ENST00000448971 610 ntTSL 314.18□□□□□ -0.143e-13■■■■□ 26.3
RPS3P23396 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.143e-13■■■■□ 26.3
RPS3P23396 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.143e-13■■■■□ 26.3
RPS3P23396 USP39-210ENST00000459775 2148 ntTSL 210.11□□□□□ -0.793e-13■■■■□ 26.3
RPS3P23396 USP39-214ENST00000474572 293 ntTSL 49.77□□□□□ -0.853e-13■■■■□ 26.3
RPS3P23396 ACO2-207ENST00000482208 624 ntTSL 317.21■□□□□ 0.351e-9■■■■□ 26.3
RPS3P23396 DBN1-204ENST00000467054 793 ntTSL 213.95□□□□□ -0.181e-7■■■■□ 26.3
RPS3P23396 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.012e-7■■■■□ 26.3
RPS3P23396 OSTC-202ENST00000505745 628 ntTSL 59.79□□□□□ -0.846e-16■■■■□ 26.3
RPS3P23396 CS-228ENST00000551473 797 ntTSL 311.19□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 26.3
RPS3P23396 CS-223ENST00000551137 903 ntTSL 311.14□□□□□ -0.631e-6■■■■□ 26.3
RPS3P23396 CS-208ENST00000547298 656 ntTSL 310.36□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 26.3
RPS3P23396 CS-233ENST00000552688 580 ntTSL 46.47□□□□□ -1.371e-6■■■■□ 26.3
RPS3P23396 ANXA5-205ENST00000509648 1083 ntTSL 23.89□□□□□ -1.792e-6■■■■□ 26.3
RPS3P23396 DDIT4-202ENST00000471240 521 ntTSL 220.72■□□□□ 0.912e-27■■■■□ 26.3
RPS3P23396 SRGN-201ENST00000242465 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-8■■■■□ 26.3
RPS3P23396 SRGN-202ENST00000462445 802 ntTSL 27.39□□□□□ -1.231e-8■■■■□ 26.3
RPS3P23396 RAE1-208ENST00000492498 1156 ntTSL 516.67■□□□□ 0.264e-7■■■■□ 26.3
RPS3P23396 RAE1-209ENST00000527947 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.534e-7■■■■□ 26.3
RPS3P23396 RAE1-203ENST00000395841 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.634e-7■■■■□ 26.3
RPS3P23396 RAE1-201ENST00000371242 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.644e-7■■■■□ 26.3
RPS3P23396 RAE1-202ENST00000395840 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.014e-7■■■■□ 26.3
RPS3P23396 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.431e-8■■■■□ 26.2
RPS3P23396 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.381e-8■■■■□ 26.2
RPS3P23396 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.161e-8■■■■□ 26.2
RPS3P23396 ATP5O-209ENST00000495005 586 ntTSL 29.71□□□□□ -0.865e-7■■■■□ 26.2
RPS3P23396 AHSG-203ENST00000478441 1269 ntTSL 212.68□□□□□ -0.381e-323■■■■□ 26.2
RPS3P23396 PGK1-205ENST00000491291 702 ntTSL 58.87□□□□□ -0.991e-17■■■■□ 26.2
RPS3P23396 ATP5B-205ENST00000548647 682 ntTSL 515.44■□□□□ 0.067e-23■■■■□ 26.2
RPS3P23396 SLC16A1-202ENST00000429288 865 ntTSL 311.67□□□□□ -0.548e-8■■■■□ 26.2
RPS3P23396 CYBA-205ENST00000565588 221 ntTSL 210.72□□□□□ -0.691e-20■■■■□ 26.2
RPS3P23396 CCT7-203ENST00000399032 593 ntTSL 419.05■□□□□ 0.645e-8■■■■□ 26.2
RPS3P23396 CCT7-207ENST00000469844 612 ntTSL 414.52□□□□□ -0.095e-8■■■■□ 26.2
RPS3P23396 CCT7-205ENST00000461290 1018 ntTSL 214.48□□□□□ -0.095e-8■■■■□ 26.2
RPS3P23396 EML2-206ENST00000586405 630 ntTSL 316.5■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 26.2
RPS3P23396 EIF3I-206ENST00000489353 527 ntTSL 310.4□□□□□ -0.743e-8■■■■□ 26.2
RPS3P23396 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.145e-10■■■■□ 26.2
RPS3P23396 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.125e-10■■■■□ 26.2
RPS3P23396 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.115e-10■■■■□ 26.2
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