Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERFP50548 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERFP50548 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERFP50548 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERFP50548 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERFP50548 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERFP50548 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERFP50548 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERFP50548 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERFP50548 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERFP50548 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERFP50548 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERFP50548 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERFP50548 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERFP50548 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERFP50548 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERFP50548 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERFP50548 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERFP50548 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERFP50548 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERFP50548 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERFP50548 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERFP50548 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms