Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RAD54BQ9Y620 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAD54BQ9Y620 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD54BQ9Y620 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD54BQ9Y620 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD54BQ9Y620 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD54BQ9Y620 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD54BQ9Y620 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD54BQ9Y620 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD54BQ9Y620 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD54BQ9Y620 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD54BQ9Y620 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD54BQ9Y620 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD54BQ9Y620 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD54BQ9Y620 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD54BQ9Y620 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD54BQ9Y620 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD54BQ9Y620 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD54BQ9Y620 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD54BQ9Y620 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD54BQ9Y620 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD54BQ9Y620 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD54BQ9Y620 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD54BQ9Y620 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54BQ9Y620 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54BQ9Y620 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54BQ9Y620 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD54BQ9Y620 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD54BQ9Y620 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD54BQ9Y620 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54BQ9Y620 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54BQ9Y620 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD54BQ9Y620 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAD54BQ9Y620 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAD54BQ9Y620 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAD54BQ9Y620 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RAD54BQ9Y620 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAD54BQ9Y620 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RAD54BQ9Y620 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAD54BQ9Y620 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD54BQ9Y620 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD54BQ9Y620 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD54BQ9Y620 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD54BQ9Y620 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD54BQ9Y620 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD54BQ9Y620 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD54BQ9Y620 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD54BQ9Y620 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD54BQ9Y620 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD54BQ9Y620 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD54BQ9Y620 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD54BQ9Y620 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD54BQ9Y620 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD54BQ9Y620 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD54BQ9Y620 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms