Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P8

WIPI2, WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPI2Q9Y4P8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WIPI2Q9Y4P8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WIPI2Q9Y4P8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WIPI2Q9Y4P8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WIPI2Q9Y4P8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
WIPI2Q9Y4P8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
WIPI2Q9Y4P8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPI2Q9Y4P8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPI2Q9Y4P8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPI2Q9Y4P8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPI2Q9Y4P8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WIPI2Q9Y4P8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WIPI2Q9Y4P8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WIPI2Q9Y4P8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WIPI2Q9Y4P8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
WIPI2Q9Y4P8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WIPI2Q9Y4P8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WIPI2Q9Y4P8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WIPI2Q9Y4P8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPI2Q9Y4P8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WIPI2Q9Y4P8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms