Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CNOT6Q9ULM6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNOT6Q9ULM6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNOT6Q9ULM6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNOT6Q9ULM6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNOT6Q9ULM6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNOT6Q9ULM6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNOT6Q9ULM6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNOT6Q9ULM6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNOT6Q9ULM6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNOT6Q9ULM6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNOT6Q9ULM6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNOT6Q9ULM6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNOT6Q9ULM6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNOT6Q9ULM6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNOT6Q9ULM6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNOT6Q9ULM6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNOT6Q9ULM6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNOT6Q9ULM6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNOT6Q9ULM6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNOT6Q9ULM6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNOT6Q9ULM6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNOT6Q9ULM6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNOT6Q9ULM6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNOT6Q9ULM6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNOT6Q9ULM6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNOT6Q9ULM6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNOT6Q9ULM6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNOT6Q9ULM6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CNOT6Q9ULM6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms