Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU7

ACAD8, Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD8Q9UKU7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACAD8Q9UKU7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACAD8Q9UKU7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACAD8Q9UKU7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACAD8Q9UKU7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACAD8Q9UKU7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACAD8Q9UKU7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACAD8Q9UKU7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACAD8Q9UKU7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACAD8Q9UKU7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACAD8Q9UKU7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACAD8Q9UKU7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACAD8Q9UKU7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACAD8Q9UKU7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACAD8Q9UKU7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ACAD8Q9UKU7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACAD8Q9UKU7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACAD8Q9UKU7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACAD8Q9UKU7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACAD8Q9UKU7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACAD8Q9UKU7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACAD8Q9UKU7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACAD8Q9UKU7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACAD8Q9UKU7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ACAD8Q9UKU7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACAD8Q9UKU7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAD8Q9UKU7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAD8Q9UKU7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAD8Q9UKU7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAD8Q9UKU7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAD8Q9UKU7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACAD8Q9UKU7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ACAD8Q9UKU7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms