Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXL3Q9UKT7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXL3Q9UKT7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXL3Q9UKT7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXL3Q9UKT7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXL3Q9UKT7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXL3Q9UKT7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXL3Q9UKT7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXL3Q9UKT7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXL3Q9UKT7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXL3Q9UKT7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXL3Q9UKT7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms