Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK12

ZNF222, Zinc finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF222Q9UK12 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF222Q9UK12 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF222Q9UK12 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF222Q9UK12 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF222Q9UK12 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF222Q9UK12 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF222Q9UK12 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF222Q9UK12 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF222Q9UK12 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF222Q9UK12 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF222Q9UK12 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF222Q9UK12 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF222Q9UK12 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF222Q9UK12 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF222Q9UK12 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF222Q9UK12 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF222Q9UK12 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF222Q9UK12 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF222Q9UK12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF222Q9UK12 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF222Q9UK12 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms