Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TUBE1Q9UJT0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TUBE1Q9UJT0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TUBE1Q9UJT0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TUBE1Q9UJT0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TUBE1Q9UJT0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TUBE1Q9UJT0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TUBE1Q9UJT0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TUBE1Q9UJT0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TUBE1Q9UJT0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TUBE1Q9UJT0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TUBE1Q9UJT0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TUBE1Q9UJT0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TUBE1Q9UJT0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TUBE1Q9UJT0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TUBE1Q9UJT0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TUBE1Q9UJT0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TUBE1Q9UJT0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TUBE1Q9UJT0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TUBE1Q9UJT0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TUBE1Q9UJT0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TUBE1Q9UJT0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TUBE1Q9UJT0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TUBE1Q9UJT0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TUBE1Q9UJT0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TUBE1Q9UJT0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TUBE1Q9UJT0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TUBE1Q9UJT0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TUBE1Q9UJT0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TUBE1Q9UJT0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TUBE1Q9UJT0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TUBE1Q9UJT0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TUBE1Q9UJT0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TUBE1Q9UJT0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TUBE1Q9UJT0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TUBE1Q9UJT0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TUBE1Q9UJT0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TUBE1Q9UJT0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TUBE1Q9UJT0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TUBE1Q9UJT0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TUBE1Q9UJT0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TUBE1Q9UJT0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TUBE1Q9UJT0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TUBE1Q9UJT0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TUBE1Q9UJT0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TUBE1Q9UJT0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TUBE1Q9UJT0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TUBE1Q9UJT0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TUBE1Q9UJT0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TUBE1Q9UJT0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TUBE1Q9UJT0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TUBE1Q9UJT0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TUBE1Q9UJT0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TUBE1Q9UJT0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TUBE1Q9UJT0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TUBE1Q9UJT0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TUBE1Q9UJT0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TUBE1Q9UJT0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TUBE1Q9UJT0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TUBE1Q9UJT0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TUBE1Q9UJT0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TUBE1Q9UJT0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TUBE1Q9UJT0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TUBE1Q9UJT0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TUBE1Q9UJT0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms