Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABGEF1Q9UJ41 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABGEF1Q9UJ41 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABGEF1Q9UJ41 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RABGEF1Q9UJ41 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGEF1Q9UJ41 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGEF1Q9UJ41 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGEF1Q9UJ41 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGEF1Q9UJ41 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGEF1Q9UJ41 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGEF1Q9UJ41 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGEF1Q9UJ41 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGEF1Q9UJ41 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RABGEF1Q9UJ41 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGEF1Q9UJ41 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGEF1Q9UJ41 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABGEF1Q9UJ41 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABGEF1Q9UJ41 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABGEF1Q9UJ41 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABGEF1Q9UJ41 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RABGEF1Q9UJ41 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RABGEF1Q9UJ41 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGEF1Q9UJ41 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGEF1Q9UJ41 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABGEF1Q9UJ41 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGEF1Q9UJ41 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGEF1Q9UJ41 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGEF1Q9UJ41 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABGEF1Q9UJ41 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABGEF1Q9UJ41 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABGEF1Q9UJ41 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABGEF1Q9UJ41 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABGEF1Q9UJ41 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABGEF1Q9UJ41 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABGEF1Q9UJ41 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RABGEF1Q9UJ41 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RABGEF1Q9UJ41 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RABGEF1Q9UJ41 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGEF1Q9UJ41 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGEF1Q9UJ41 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABGEF1Q9UJ41 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGEF1Q9UJ41 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGEF1Q9UJ41 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABGEF1Q9UJ41 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABGEF1Q9UJ41 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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