Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ARHGEF12Q9NZN5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ARHGEF12Q9NZN5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARHGEF12Q9NZN5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
ARHGEF12Q9NZN5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ARHGEF12Q9NZN5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ARHGEF12Q9NZN5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ARHGEF12Q9NZN5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGEF12Q9NZN5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGEF12Q9NZN5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGEF12Q9NZN5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
ARHGEF12Q9NZN5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ARHGEF12Q9NZN5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ARHGEF12Q9NZN5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
ARHGEF12Q9NZN5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ARHGEF12Q9NZN5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
ARHGEF12Q9NZN5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
ARHGEF12Q9NZN5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ARHGEF12Q9NZN5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ARHGEF12Q9NZN5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
ARHGEF12Q9NZN5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
ARHGEF12Q9NZN5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
ARHGEF12Q9NZN5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
ARHGEF12Q9NZN5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ARHGEF12Q9NZN5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ARHGEF12Q9NZN5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
ARHGEF12Q9NZN5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
ARHGEF12Q9NZN5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
ARHGEF12Q9NZN5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ARHGEF12Q9NZN5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ARHGEF12Q9NZN5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ARHGEF12Q9NZN5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ARHGEF12Q9NZN5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ARHGEF12Q9NZN5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ARHGEF12Q9NZN5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ARHGEF12Q9NZN5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ARHGEF12Q9NZN5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ARHGEF12Q9NZN5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ARHGEF12Q9NZN5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ARHGEF12Q9NZN5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ARHGEF12Q9NZN5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ARHGEF12Q9NZN5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ARHGEF12Q9NZN5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ARHGEF12Q9NZN5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ARHGEF12Q9NZN5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ARHGEF12Q9NZN5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ARHGEF12Q9NZN5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ARHGEF12Q9NZN5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
ARHGEF12Q9NZN5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARHGEF12Q9NZN5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
ARHGEF12Q9NZN5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ARHGEF12Q9NZN5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ARHGEF12Q9NZN5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ARHGEF12Q9NZN5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ARHGEF12Q9NZN5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ARHGEF12Q9NZN5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ARHGEF12Q9NZN5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.11
ARHGEF12Q9NZN5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGEF12Q9NZN5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGEF12Q9NZN5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGEF12Q9NZN5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGEF12Q9NZN5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ARHGEF12Q9NZN5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ARHGEF12Q9NZN5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ARHGEF12Q9NZN5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ARHGEF12Q9NZN5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ARHGEF12Q9NZN5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ARHGEF12Q9NZN5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ARHGEF12Q9NZN5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ARHGEF12Q9NZN5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ARHGEF12Q9NZN5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ARHGEF12Q9NZN5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ARHGEF12Q9NZN5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ARHGEF12Q9NZN5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ARHGEF12Q9NZN5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGEF12Q9NZN5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGEF12Q9NZN5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGEF12Q9NZN5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
ARHGEF12Q9NZN5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
ARHGEF12Q9NZN5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms