Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.593e-9■■■■■ 34.1
SLTMQ9NWH9 TMEM8A-208ENST00000476735 801 ntTSL 518.48■□□□□ 0.553e-9■■■■■ 34.1
SLTMQ9NWH9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.493e-9■■■■■ 34.1
SLTMQ9NWH9 MTG1-202ENST00000432508 953 ntTSL 217.45■□□□□ 0.383e-9■■■■■ 34.1
SLTMQ9NWH9 MTG1-203ENST00000460848 2730 ntTSL 215.01□□□□□ -0.013e-9■■■■■ 34.1
SLTMQ9NWH9 TMEM8A-203ENST00000427313 587 ntTSL 412.51□□□□□ -0.413e-9■■■■■ 34.1
SLTMQ9NWH9 MVK-205ENST00000537237 1296 ntTSL 529.92■■■□□ 2.382e-6■■■■■ 34
SLTMQ9NWH9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.292e-6■■■■■ 34
SLTMQ9NWH9 MVK-203ENST00000447878 1644 ntTSL 227■■□□□ 1.912e-6■■■■■ 34
SLTMQ9NWH9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 34
SLTMQ9NWH9 MVK-216ENST00000636996 1725 ntTSL 518.51■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 34
SLTMQ9NWH9 MVK-215ENST00000636529 1509 ntTSL 516.71■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 34
SLTMQ9NWH9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 34
SLTMQ9NWH9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 34
SLTMQ9NWH9 MVK-202ENST00000392727 1770 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 34
SLTMQ9NWH9 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 34
SLTMQ9NWH9 MVK-209ENST00000540353 4109 ntTSL 211.45□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 34
SLTMQ9NWH9 TRAPPC9-203ENST00000517667 518 ntTSL 311.76□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 33.9
SLTMQ9NWH9 TRAPPC9-207ENST00000520532 560 ntTSL 57.72□□□□□ -1.176e-7■■■■■ 33.9
SLTMQ9NWH9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 33.9
SLTMQ9NWH9 NFIA-210ENST00000479364 1010 ntTSL 513.04□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 33.9
SLTMQ9NWH9 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 33.9
SLTMQ9NWH9 NFIA-202ENST00000371184 1348 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 33.9
SLTMQ9NWH9 NFIA-203ENST00000371185 1714 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 33.9
SLTMQ9NWH9 NFIA-212ENST00000485903 1674 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 33.9
SLTMQ9NWH9 NFIA-206ENST00000371191 1916 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 33.9
SLTMQ9NWH9 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 33.9
SLTMQ9NWH9 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 33.9
SLTMQ9NWH9 NFIA-209ENST00000476646 730 ntTSL 35.03□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 33.9
SLTMQ9NWH9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.415e-8■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.233e-8■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 218.15■□□□□ 0.53e-8■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 516.9■□□□□ 0.33e-8■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.243e-8■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.23e-8■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 215.14■□□□□ 0.013e-8■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 215.09■□□□□ 0.013e-8■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.053e-8■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 AC037459.3-201ENST00000521025 2750 ntBASIC13.2□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 410.02□□□□□ -0.813e-8■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 29.02□□□□□ -0.973e-8■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -13e-8■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 LINC01606-204ENST00000519241 509 ntTSL 320.12■□□□□ 0.815e-7■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 LINC01606-209ENST00000523341 714 ntTSL 313.39□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 33.8
SLTMQ9NWH9 MTCL1-212ENST00000522146 580 ntTSL 46.19□□□□□ -1.428e-7■■■■■ 33.7
SLTMQ9NWH9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.26e-7■■■■■ 33.6
SLTMQ9NWH9 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 33.5
SLTMQ9NWH9 MCM3AP-AS1-209ENST00000591223 572 ntTSL 414.37□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 33.5
SLTMQ9NWH9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 33.4
SLTMQ9NWH9 MCM3AP-AS1-205ENST00000444998 2193 ntTSL 26.92□□□□□ -1.31e-7■■■■■ 33.4
SLTMQ9NWH9 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 33.4
SLTMQ9NWH9 SYMPK-212ENST00000598896 1899 ntTSL 1 (best)24.22■■□□□ 1.473e-6■■■■■ 33.3
SLTMQ9NWH9 SYMPK-208ENST00000598059 611 ntTSL 422.04■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 33.3
SLTMQ9NWH9 SYMPK-205ENST00000594293 623 ntTSL 418.16■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 33.3
SLTMQ9NWH9 SYMPK-204ENST00000593959 546 ntTSL 417.06■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 33.3
SLTMQ9NWH9 SYMPK-202ENST00000593504 5107 ntTSL 216.46■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 33.3
SLTMQ9NWH9 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.215e-11■■■■■ 33.3
SLTMQ9NWH9 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 33.3
SLTMQ9NWH9 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.015e-11■■■■■ 33.3
SLTMQ9NWH9 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 33.3
SLTMQ9NWH9 SYMPK-218ENST00000602061 503 ntTSL 413.08□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 33.3
SLTMQ9NWH9 EML4-202ENST00000401738 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.695e-11■■■■■ 33.3
SLTMQ9NWH9 BRF1-204ENST00000392557 3579 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 33.2
SLTMQ9NWH9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 NEK6-211ENST00000454453 732 ntTSL 326.19■■□□□ 1.787e-7■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.367e-7■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 CTDSP1-213ENST00000496785 460 ntTSL 520.03■□□□□ 0.81e-8■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 CTDSP1-207ENST00000473420 922 ntTSL 319.76■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 CTDSP1-215ENST00000498160 877 ntTSL 518.31■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 CTDSP1-203ENST00000431127 586 ntTSL 318.07■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.31e-8■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 CTDSP1-214ENST00000497677 998 ntTSL 216.55■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 CTDSP1-209ENST00000488627 1118 ntTSL 316.55■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 CTDSP1-202ENST00000428361 842 ntTSL 516.04■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 CTDSP1-205ENST00000452977 818 ntTSL 516.04■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 CTDSP1-210ENST00000491064 786 ntTSL 313.99□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 CTDSP1-208ENST00000482272 984 ntTSL 213.93□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 CTDSP1-212ENST00000494067 362 ntTSL 313.86□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC13.55□□□□□ -0.241e-8■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 CTDSP1-206ENST00000464255 926 ntTSL 513.54□□□□□ -0.241e-8■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.277e-7■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 NEK6-212ENST00000539416 2582 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.387e-7■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 NEK6-203ENST00000373600 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.427e-7■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 NEK6-201ENST00000320246 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.497e-7■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 NEK6-215ENST00000546191 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.737e-7■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 NEK6-204ENST00000373603 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.837e-7■■■■■ 33.1
SLTMQ9NWH9 TFPT-204ENST00000420715 737 ntTSL 523.75■■□□□ 1.391e-6■■■■■ 33
SLTMQ9NWH9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.391e-6■■■■■ 33
SLTMQ9NWH9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.391e-6■■■■■ 33
SLTMQ9NWH9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 33
SLTMQ9NWH9 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 416.97■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 32.9
SLTMQ9NWH9 RPH3AL-216ENST00000575130 579 ntTSL 416.82■□□□□ 0.287e-9■■■■■ 32.8
SLTMQ9NWH9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 32.8
SLTMQ9NWH9 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 32.5
SLTMQ9NWH9 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 32.5
SLTMQ9NWH9 MCM3AP-AS1-207ENST00000588753 589 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 32.4
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