Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIC8BQ9NVN3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIC8BQ9NVN3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIC8BQ9NVN3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIC8BQ9NVN3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIC8BQ9NVN3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RIC8BQ9NVN3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIC8BQ9NVN3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RIC8BQ9NVN3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIC8BQ9NVN3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIC8BQ9NVN3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIC8BQ9NVN3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIC8BQ9NVN3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIC8BQ9NVN3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIC8BQ9NVN3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIC8BQ9NVN3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIC8BQ9NVN3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIC8BQ9NVN3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIC8BQ9NVN3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIC8BQ9NVN3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RIC8BQ9NVN3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RIC8BQ9NVN3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIC8BQ9NVN3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RIC8BQ9NVN3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIC8BQ9NVN3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIC8BQ9NVN3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIC8BQ9NVN3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIC8BQ9NVN3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIC8BQ9NVN3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIC8BQ9NVN3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIC8BQ9NVN3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIC8BQ9NVN3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RIC8BQ9NVN3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIC8BQ9NVN3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIC8BQ9NVN3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIC8BQ9NVN3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIC8BQ9NVN3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms