Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC40A1Q9NP59 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC40A1Q9NP59 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC40A1Q9NP59 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC40A1Q9NP59 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC40A1Q9NP59 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC40A1Q9NP59 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC40A1Q9NP59 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC40A1Q9NP59 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC40A1Q9NP59 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC40A1Q9NP59 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC40A1Q9NP59 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC40A1Q9NP59 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC40A1Q9NP59 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC40A1Q9NP59 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC40A1Q9NP59 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC40A1Q9NP59 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC40A1Q9NP59 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC40A1Q9NP59 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC40A1Q9NP59 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC40A1Q9NP59 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC40A1Q9NP59 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC40A1Q9NP59 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC40A1Q9NP59 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC40A1Q9NP59 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC40A1Q9NP59 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC40A1Q9NP59 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC40A1Q9NP59 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC40A1Q9NP59 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC40A1Q9NP59 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC40A1Q9NP59 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC40A1Q9NP59 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC40A1Q9NP59 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC40A1Q9NP59 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms