Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOD2Q9HC29 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NOD2Q9HC29 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOD2Q9HC29 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOD2Q9HC29 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOD2Q9HC29 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOD2Q9HC29 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOD2Q9HC29 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NOD2Q9HC29 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOD2Q9HC29 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOD2Q9HC29 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOD2Q9HC29 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOD2Q9HC29 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOD2Q9HC29 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOD2Q9HC29 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOD2Q9HC29 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOD2Q9HC29 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOD2Q9HC29 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOD2Q9HC29 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOD2Q9HC29 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOD2Q9HC29 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOD2Q9HC29 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOD2Q9HC29 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOD2Q9HC29 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOD2Q9HC29 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOD2Q9HC29 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOD2Q9HC29 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOD2Q9HC29 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOD2Q9HC29 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOD2Q9HC29 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOD2Q9HC29 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOD2Q9HC29 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOD2Q9HC29 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOD2Q9HC29 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOD2Q9HC29 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOD2Q9HC29 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOD2Q9HC29 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOD2Q9HC29 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOD2Q9HC29 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOD2Q9HC29 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOD2Q9HC29 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOD2Q9HC29 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOD2Q9HC29 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOD2Q9HC29 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOD2Q9HC29 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOD2Q9HC29 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOD2Q9HC29 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOD2Q9HC29 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOD2Q9HC29 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOD2Q9HC29 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOD2Q9HC29 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOD2Q9HC29 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOD2Q9HC29 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOD2Q9HC29 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOD2Q9HC29 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOD2Q9HC29 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOD2Q9HC29 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOD2Q9HC29 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOD2Q9HC29 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOD2Q9HC29 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOD2Q9HC29 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOD2Q9HC29 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOD2Q9HC29 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOD2Q9HC29 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms