Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1BQ9H9Y6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
POLR1BQ9H9Y6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1BQ9H9Y6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1BQ9H9Y6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1BQ9H9Y6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1BQ9H9Y6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1BQ9H9Y6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1BQ9H9Y6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1BQ9H9Y6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1BQ9H9Y6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1BQ9H9Y6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1BQ9H9Y6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1BQ9H9Y6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1BQ9H9Y6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR1BQ9H9Y6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1BQ9H9Y6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1BQ9H9Y6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1BQ9H9Y6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1BQ9H9Y6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1BQ9H9Y6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1BQ9H9Y6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1BQ9H9Y6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1BQ9H9Y6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1BQ9H9Y6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1BQ9H9Y6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1BQ9H9Y6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1BQ9H9Y6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1BQ9H9Y6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1BQ9H9Y6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1BQ9H9Y6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1BQ9H9Y6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLR1BQ9H9Y6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1BQ9H9Y6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1BQ9H9Y6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1BQ9H9Y6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1BQ9H9Y6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1BQ9H9Y6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1BQ9H9Y6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1BQ9H9Y6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1BQ9H9Y6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1BQ9H9Y6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms