Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SCAF1Q9H7N4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
SCAF1Q9H7N4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
SCAF1Q9H7N4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
SCAF1Q9H7N4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SCAF1Q9H7N4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
SCAF1Q9H7N4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SCAF1Q9H7N4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SCAF1Q9H7N4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
SCAF1Q9H7N4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SCAF1Q9H7N4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SCAF1Q9H7N4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SCAF1Q9H7N4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SCAF1Q9H7N4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SCAF1Q9H7N4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
SCAF1Q9H7N4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SCAF1Q9H7N4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SCAF1Q9H7N4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SCAF1Q9H7N4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SCAF1Q9H7N4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SCAF1Q9H7N4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SCAF1Q9H7N4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
SCAF1Q9H7N4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SCAF1Q9H7N4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SCAF1Q9H7N4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SCAF1Q9H7N4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
SCAF1Q9H7N4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SCAF1Q9H7N4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SCAF1Q9H7N4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SCAF1Q9H7N4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
SCAF1Q9H7N4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SCAF1Q9H7N4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
SCAF1Q9H7N4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SCAF1Q9H7N4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SCAF1Q9H7N4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SCAF1Q9H7N4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
SCAF1Q9H7N4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
SCAF1Q9H7N4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
SCAF1Q9H7N4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SCAF1Q9H7N4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SCAF1Q9H7N4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SCAF1Q9H7N4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SCAF1Q9H7N4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SCAF1Q9H7N4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SCAF1Q9H7N4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SCAF1Q9H7N4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SCAF1Q9H7N4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SCAF1Q9H7N4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SCAF1Q9H7N4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SCAF1Q9H7N4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SCAF1Q9H7N4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
SCAF1Q9H7N4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
SCAF1Q9H7N4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SCAF1Q9H7N4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
SCAF1Q9H7N4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SCAF1Q9H7N4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.84
SCAF1Q9H7N4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
SCAF1Q9H7N4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC39■■■■□ 3.83
SCAF1Q9H7N4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SCAF1Q9H7N4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
SCAF1Q9H7N4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SCAF1Q9H7N4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SCAF1Q9H7N4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
SCAF1Q9H7N4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SCAF1Q9H7N4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SCAF1Q9H7N4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
SCAF1Q9H7N4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SCAF1Q9H7N4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
SCAF1Q9H7N4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SCAF1Q9H7N4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SCAF1Q9H7N4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SCAF1Q9H7N4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SCAF1Q9H7N4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SCAF1Q9H7N4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SCAF1Q9H7N4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SCAF1Q9H7N4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SCAF1Q9H7N4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SCAF1Q9H7N4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SCAF1Q9H7N4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SCAF1Q9H7N4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SCAF1Q9H7N4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SCAF1Q9H7N4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
SCAF1Q9H7N4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SCAF1Q9H7N4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SCAF1Q9H7N4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SCAF1Q9H7N4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SCAF1Q9H7N4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SCAF1Q9H7N4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SCAF1Q9H7N4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SCAF1Q9H7N4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SCAF1Q9H7N4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SCAF1Q9H7N4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SCAF1Q9H7N4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SCAF1Q9H7N4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SCAF1Q9H7N4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SCAF1Q9H7N4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SCAF1Q9H7N4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SCAF1Q9H7N4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SCAF1Q9H7N4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SCAF1Q9H7N4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms