Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
HIRIP3Q9BW71 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
HIRIP3Q9BW71 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
HIRIP3Q9BW71 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
HIRIP3Q9BW71 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
HIRIP3Q9BW71 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
HIRIP3Q9BW71 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
HIRIP3Q9BW71 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
HIRIP3Q9BW71 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
HIRIP3Q9BW71 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
HIRIP3Q9BW71 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
HIRIP3Q9BW71 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
HIRIP3Q9BW71 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
HIRIP3Q9BW71 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
HIRIP3Q9BW71 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
HIRIP3Q9BW71 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
HIRIP3Q9BW71 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
HIRIP3Q9BW71 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
HIRIP3Q9BW71 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
HIRIP3Q9BW71 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
HIRIP3Q9BW71 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
HIRIP3Q9BW71 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
HIRIP3Q9BW71 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
HIRIP3Q9BW71 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
HIRIP3Q9BW71 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
HIRIP3Q9BW71 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
HIRIP3Q9BW71 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
HIRIP3Q9BW71 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HIRIP3Q9BW71 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
HIRIP3Q9BW71 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
HIRIP3Q9BW71 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
HIRIP3Q9BW71 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
HIRIP3Q9BW71 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
HIRIP3Q9BW71 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
HIRIP3Q9BW71 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
HIRIP3Q9BW71 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
HIRIP3Q9BW71 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
HIRIP3Q9BW71 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
HIRIP3Q9BW71 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
HIRIP3Q9BW71 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
HIRIP3Q9BW71 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
HIRIP3Q9BW71 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
HIRIP3Q9BW71 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
HIRIP3Q9BW71 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
HIRIP3Q9BW71 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
HIRIP3Q9BW71 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
HIRIP3Q9BW71 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
HIRIP3Q9BW71 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
HIRIP3Q9BW71 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
HIRIP3Q9BW71 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
HIRIP3Q9BW71 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms